Scielo RSS <![CDATA[Revista argentina de microbiología]]> http://www.scielo.org.ar/rss.php?pid=0325-754120140004&lang=pt vol. 46 num. 3 lang. pt <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.org.ar/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.ar <![CDATA[Close relationships between microorganisms and cancer]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400001&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt <![CDATA[Distribution of phylogenetic groups and virulence factors in CTX-M-15 ß -lactamase-producing uropathogenic Escherichia coli strains isolated from patients in the community of Mérida, Venezuela]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400002&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt En este estudio se determinó el perfil de distribución de grupos filogéneticos y la detección genética de factores de virulencia en cepas de Escherichia coli uropatógena (ECUP) productoras de ß-lactamasa CTX-M-15. Veintiocho cepas fueron aisladas de pacientes con infección del tracto urinario (ITU) que asistieron al Laboratorio de Salud Pública del estado Mérida, Venezuela, durante el lapso comprendido entre enero 2009 y julio 2011. La determinación de los grupos filogenéticos y la detección de seis genes de virulencia, fimH, fyuA, kpsMTII, usp, PAI y papAH, se realizó mediante amplificación por PCR. Quince cepas de 28 se ubicaron principalmente en el filogrupo A, seguidos por el B2 (12/28) y D (1/28). No se observó una relación directa entre la recurrencia o gravedad de la ITU y la distribución de los filogrupos. Todos los factores de virulencia estudiados se encontraron con la frecuencia más alta en el grupo B2. El perfil de virulencia prevalente estuvo conformado por la asociación de tres genes principales: fimH, fyuA y kpsMTII y en menor frecuencia, por la presencia de otros determinantes como usp, PAI y/o papAH. Estos resultados indican que la mayoría de ECUP estuvieron dotadas de tres propiedades virulentas importantes: adhesión, captación de hierro y evasión de la fagocitosis, las cuales favorecieron la producción de ITU recurrentes. Este es el primer trabajo que describe la asociación de grupos filogenéticos con el potencial de virulencia de cepas de ECUP productoras de ß-lactamasa CTX-M-15 en Venezuela.<hr/>In this study, the distribution of phylogenetic groups and the genetic detection of virulence factors in CTX-M-15 ß-lactamase-producing uropathogenic Escherichia coli (UPEC) strains were analyzed. Twenty eight strains were isolated between January 2009 and July 2011 from patients with urinary tract infection (UTI) who attended the Public Health Laboratory at Mérida, Venezuela. Determination of phylogenetic groups and detection of six virulence genes, fimH, fyuA, kpsMTII, usp, PAI and papAH, were performed by PCR amplification. Fifteen of the 28 isolates were mainly located in the phylogenetic group A, followed by B2 (12/28) and D (1/28). No direct relationship between the severity or recurrence of UTI and the distribution of phylogroups was observed. All studied virulence factors were found in group B2 strains with the highest frequency. The prevalent virulence profile included the combination of three main genes: fimH, kpsMTII and fyuA and, to a lesser extent, the presence of other determinants such as usp, PAI and/or papAH. These results indicate that virulent UPEC incorporated three important properties: adhesion, iron uptake and evasion of phagocytosis, which favored the production of recurrent UTI. This is the first report describing the association of phylogenetic groups with the potential virulence of CTX-M-15 ß-lactamase producing UPEC strains in Venezuela. <![CDATA[Evaluation of vaginal dysfunction in symptomatic and asymptomatic pregnant women by using the analysis of basic vaginal states (BVS) and its comparison with the conventional microbiological study]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400003&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Durante el embarazo se producen frecuentemente infecciones del tracto genital inferior asociadas a complicaciones maternas y perinatológicas. El objetivo del trabajo fue evaluar la disfunción vaginal mediante el análisis de los estados vaginales básicos (EVB) por la metodología del balance del contenido vaginal (BACOVA) y compararlo con el estudio microbiológico convencional en el diagnóstico de candidiasis, tricomonosis y vaginosis bacteriana (VB). Entre 2010 y 2012 se estudiaron 1238 pacientes embarazadas; 1046 eran asintomáticas (A) y 192 sintomáticas (S). La prevalencia del EVB I fue del 59,5 % y 26 %, respectivamente. El EVB II se observó en 19,7 % de las mujeres A y en 17,2 % de las S. El EVB III se detectó solamente en las A, en 0,4 %. El EVB IV se observó en 14,4 % de las A y en 38 % de las S. El EVB V se detectó en 6 % de las A y en 18,8 % de las S. En las mujeres A, las levaduras se asociaron a los EVB I y II en el 55,5 % y 23,2 % de los casos, respectivamente; entre las S, alcanzaron el 32,4 % y 31 % de los casos, en igual orden. Las tricomonas se asociaron al EVB I en el 50 % de las A, al EVB IV en el 44,4 % de las S y al EVB V en el 33,3 % de las S. La sensibilidad del BACOVA para detectar levaduras fue 80,4 % en las A y 85,5 % en las S; para detectar tricomonas, del 40 % y 75 %, y para detectar VB, del 100 % en los dos grupos. La especificidad del BACOVA fue 100 % para todos los patógenos en las A y en las S. El estudio de los EVB resultó útil para orientar el diagnóstico a la disfunción vaginal, independientemente de la sintomatología, por lo que se sugiere este estudio como parte del control prenatal. Durante el embarazo se producen frecuentemente infecciones del tracto genital inferior asociadas a complicaciones maternas y perinatológicas. El objetivo del trabajo fue evaluar la disfunción vaginal mediante el análisis de los estados vaginales básicos (EVB) por la metodología del balance del contenido vaginal (BACOVA) y compararlo con el estudio microbiológico convencional en el diagnóstico de candidiasis, tricomonosis y vaginosis bacteriana (VB). Entre 2010 y 2012 se estudiaron 1238 pacientes embarazadas; 1046 eran asintomáticas (A) y 192 sintomáticas (S). La prevalencia del EVB I fue del 59,5 % y 26 %, respectivamente. El EVB II se observó en 19,7 % de las mujeres A y en 17,2 % de las S. El EVB III se detectó solamente en las A, en 0,4 %. El EVB IV se observó en 14,4 % de las A y en 38 % de las S. El EVB V se detectó en 6 % de las A y en 18,8 % de las S. En las mujeres A, las levaduras se asociaron a los EVB I y II en el 55,5 % y 23,2 % de los casos, respectivamente; entre las S, alcanzaron el 32,4 % y 31 % de los casos, en igual orden. Las tricomonas se asociaron al EVB I en el 50 % de las A, al EVB IV en el 44,4 % de las S y al EVB V en el 33,3 % de las S. La sensibilidad del BACOVA para detectar levaduras fue 80,4 % en las A y 85,5 % en las S; para detectar tricomonas, del 40 % y 75 %, y para detectar VB, del 100 % en los dos grupos. La especificidad del BACOVA fue 100 % para todos los patógenos en las A y en las S. El estudio de los EVB resultó útil para orientar el diagnóstico a la disfunción vaginal, independientemente de la sintomatología, por lo que se sugiere este estudio como parte del control prenatal.<hr/>Infections of the lower genital tract associated to maternal and perinatal complications frequently occur during pregnancy. The aim of this study was to evaluate vaginal dysfunction through the analysis of basic vaginal states (BVS) using the methodology of balance of the vaginal content (BAVACO) and to compare it with the microbiological study of candidiasis, trichomoniasis and bacterial vaginosis (BV). Pregnant patients (1238) were examined from 2010 to 2012. In asymptomatic (A) (n: 1046) and symptomatic pregnant women (S) (n: 192) BVS I was 59.5% and 26% of the patients, respectively. BVS II was observed in 19.7% of A and in 17.2% of S. BVS III was only detected in A in 0.4%. BVS IV was observed in 14.4% of A and in 38% of S. BVS V was detected in 6% of A and in 18.8% of S. Yeasts were associated to BVS I and II in 55.5% and 23.2% of A, respectively; and in 32.4% and 31% of S, respectively. Trichomonas were associated to BVS I in 50% of A, to IV in 44.4% of S and to V in 33.3% of S. BAVACO susceptibility to detect yeasts was 80.4% and 85.5% in A and S, respectively; 40% and 75% in A and S, respectively, to detect trichomonas and 100% in A and S to detect BV. BAVACO specificity was 100% for all pathogens in A and S. The study of BVS proved useful as a guide to evaluate vaginal dysfunction, regardless of symptomatology. Therefore, this study is recommended as prenatal control. Infections of the lower genital tract associated to maternal and perinatal complications frequently occur during pregnancy. The aim of this study was to evaluate vaginal dysfunction through the analysis of basic vaginal states (BVS) using the methodology of balance of the vaginal content (BAVACO) and to compare it with the microbiological study of candidiasis, trichomoniasis and bacterial vaginosis (BV). Pregnant patients (1238) were examined from 2010 to 2012. In asymptomatic (A) (n: 1046) and symptomatic pregnant women (S) (n: 192) BVS I was 59.5% and 26% of the patients, respectively. BVS II was observed in 19.7% of A and in 17.2% of S. BVS III was only detected in A in 0.4%. BVS IV was observed in 14.4% of A and in 38% of S. BVS V was detected in 6% of A and in 18.8% of S. Yeasts were associated to BVS I and II in 55.5% and 23.2% of A, respectively; and in 32.4% and 31% of S, respectively. Trichomonas were associated to BVS I in 50% of A, to IV in 44.4% of S and to V in 33.3% of S. BAVACO susceptibility to detect yeasts was 80.4% and 85.5% in A and S, respectively; 40% and 75% in A and S, respectively, to detect trichomonas and 100% in A and S to detect BV. BAVACO specificity was 100% for all pathogens in A and S. The study of BVS proved useful as a guide to evaluate vaginal dysfunction, regardless of symptomatology. Therefore, this study is recommended as prenatal control. <![CDATA[Validation of a real time RT-PCR assay to detect foot-and-mouth disease virus and assessment of its performance in acute infection]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400004&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Durante el embarazo se producen frecuentemente infecciones del tracto genital inferior asociadas a complicaciones maternas y perinatológicas. El objetivo del trabajo fue evaluar la disfunción vaginal mediante el análisis de los estados vaginales básicos (EVB) por la metodología del balance del contenido vaginal (BACOVA) y compararlo con el estudio microbiológico convencional en el diagnóstico de candidiasis, tricomonosis y vaginosis bacteriana (VB). Entre 2010 y 2012 se estudiaron 1238 pacientes embarazadas; 1046 eran asintomáticas (A) y 192 sintomáticas (S). La prevalencia del EVB I fue del 59,5 % y 26 %, respectivamente. El EVB II se observó en 19,7 % de las mujeres A y en 17,2 % de las S. El EVB III se detectó solamente en las A, en 0,4 %. El EVB IV se observó en 14,4 % de las A y en 38 % de las S. El EVB V se detectó en 6 % de las A y en 18,8 % de las S. En las mujeres A, las levaduras se asociaron a los EVB I y II en el 55,5 % y 23,2 % de los casos, respectivamente; entre las S, alcanzaron el 32,4 % y 31 % de los casos, en igual orden. Las tricomonas se asociaron al EVB I en el 50 % de las A, al EVB IV en el 44,4 % de las S y al EVB V en el 33,3 % de las S. La sensibilidad del BACOVA para detectar levaduras fue 80,4 % en las A y 85,5 % en las S; para detectar tricomonas, del 40 % y 75 %, y para detectar VB, del 100 % en los dos grupos. La especificidad del BACOVA fue 100 % para todos los patógenos en las A y en las S. El estudio de los EVB resultó útil para orientar el diagnóstico a la disfunción vaginal, independientemente de la sintomatología, por lo que se sugiere este estudio como parte del control prenatal. Durante el embarazo se producen frecuentemente infecciones del tracto genital inferior asociadas a complicaciones maternas y perinatológicas. El objetivo del trabajo fue evaluar la disfunción vaginal mediante el análisis de los estados vaginales básicos (EVB) por la metodología del balance del contenido vaginal (BACOVA) y compararlo con el estudio microbiológico convencional en el diagnóstico de candidiasis, tricomonosis y vaginosis bacteriana (VB). Entre 2010 y 2012 se estudiaron 1238 pacientes embarazadas; 1046 eran asintomáticas (A) y 192 sintomáticas (S). La prevalencia del EVB I fue del 59,5 % y 26 %, respectivamente. El EVB II se observó en 19,7 % de las mujeres A y en 17,2 % de las S. El EVB III se detectó solamente en las A, en 0,4 %. El EVB IV se observó en 14,4 % de las A y en 38 % de las S. El EVB V se detectó en 6 % de las A y en 18,8 % de las S. En las mujeres A, las levaduras se asociaron a los EVB I y II en el 55,5 % y 23,2 % de los casos, respectivamente; entre las S, alcanzaron el 32,4 % y 31 % de los casos, en igual orden. Las tricomonas se asociaron al EVB I en el 50 % de las A, al EVB IV en el 44,4 % de las S y al EVB V en el 33,3 % de las S. La sensibilidad del BACOVA para detectar levaduras fue 80,4 % en las A y 85,5 % en las S; para detectar tricomonas, del 40 % y 75 %, y para detectar VB, del 100 % en los dos grupos. La especificidad del BACOVA fue 100 % para todos los patógenos en las A y en las S. El estudio de los EVB resultó útil para orientar el diagnóstico a la disfunción vaginal, independientemente de la sintomatología, por lo que se sugiere este estudio como parte del control prenatal.<hr/>Infections of the lower genital tract associated to maternal and perinatal complications frequently occur during pregnancy. The aim of this study was to evaluate vaginal dysfunction through the analysis of basic vaginal states (BVS) using the methodology of balance of the vaginal content (BAVACO) and to compare it with the microbiological study of candidiasis, trichomoniasis and bacterial vaginosis (BV). Pregnant patients (1238) were examined from 2010 to 2012. In asymptomatic (A) (n: 1046) and symptomatic pregnant women (S) (n: 192) BVS I was 59.5% and 26% of the patients, respectively. BVS II was observed in 19.7% of A and in 17.2% of S. BVS III was only detected in A in 0.4%. BVS IV was observed in 14.4% of A and in 38% of S. BVS V was detected in 6% of A and in 18.8% of S. Yeasts were associated to BVS I and II in 55.5% and 23.2% of A, respectively; and in 32.4% and 31% of S, respectively. Trichomonas were associated to BVS I in 50% of A, to IV in 44.4% of S and to V in 33.3% of S. BAVACO susceptibility to detect yeasts was 80.4% and 85.5% in A and S, respectively; 40% and 75% in A and S, respectively, to detect trichomonas and 100% in A and S to detect BV. BAVACO specificity was 100% for all pathogens in A and S. The study of BVS proved useful as a guide to evaluate vaginal dysfunction, regardless of symptomatology. Therefore, this study is recommended as prenatal control. Infections of the lower genital tract associated to maternal and perinatal complications frequently occur during pregnancy. The aim of this study was to evaluate vaginal dysfunction through the analysis of basic vaginal states (BVS) using the methodology of balance of the vaginal content (BAVACO) and to compare it with the microbiological study of candidiasis, trichomoniasis and bacterial vaginosis (BV). Pregnant patients (1238) were examined from 2010 to 2012. In asymptomatic (A) (n: 1046) and symptomatic pregnant women (S) (n: 192) BVS I was 59.5% and 26% of the patients, respectively. BVS II was observed in 19.7% of A and in 17.2% of S. BVS III was only detected in A in 0.4%. BVS IV was observed in 14.4% of A and in 38% of S. BVS V was detected in 6% of A and in 18.8% of S. Yeasts were associated to BVS I and II in 55.5% and 23.2% of A, respectively; and in 32.4% and 31% of S, respectively. Trichomonas were associated to BVS I in 50% of A, to IV in 44.4% of S and to V in 33.3% of S. BAVACO susceptibility to detect yeasts was 80.4% and 85.5% in A and S, respectively; 40% and 75% in A and S, respectively, to detect trichomonas and 100% in A and S to detect BV. BAVACO specificity was 100% for all pathogens in A and S. The study of BVS proved useful as a guide to evaluate vaginal dysfunction, regardless of symptomatology. Therefore, this study is recommended as prenatal control. <![CDATA[Sensitivity of the COBAS AmpliScreen<sup>TM</sup>HIV-1 Test v1.5 for HIV-1 detection]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400005&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Las técnicas de amplificación de ácidos nucleicos (NAT) se incorporaron en los bancos de sangre para reducir el riesgo residual de transmisión de infecciones por vía transfusional. La cocirculación de distintas variantes del HIV-1 en Argentina indica la necesidad de evaluar la sensibilidad de los ensayos serológicos y moleculares disponibles para su detección. En este trabajo se evaluó la sensibilidad del equipo COBAS AmpliScreenTM HIV-1 Test, versión 1.5 (Roche), para detectar ARN viral en plasmas de individuos infectados con HIV-1 de Argentina. Los resultados demuestran que esta técnica tiene una alta sensibilidad para detectar ARN de HIV-1 en las condiciones ensayadas: para ensayo de mini-pooles (pooles = 50 copias de ARN/ml), la sensibilidad fue = 92 %, y para procedimiento estándar (plasmas = 207 copias de ARN/ml), la sensibilidad fue 100 %. Además, la técnica COBAS AmpliScreenTM HIV-1 Test, versión 1.5 (Roche), es adecuada para la detección de las variantes de HIV-1 prevalentes.<hr/>The introduction of nucleic acid amplification techniques (NAT) in blood banks was intended to reduce the residual risk of transfusion-transmitted infections. Co-circulation of a great diversity of HIV-1 variants in Argentina portrays the need to assess the sensitivity of serological and molecular assays available for their detection. In this study, we evaluated the sensitivity of the COBAS AmpliScreenTM HIV-1 Test, version 1.5 (Roche) for the detection of HIV-1 RNA in plasma samples of infected individuals from Argentina. The results of this study reveal that this technique has high sensitivity for the detection of HIV-1 RNA under assay conditions: using mini-pool testing, pools = 50 RNA copies per ml achieved = 92 % sensitivity, whereas in the standard procedure, samples = 207 RNA copies/ ml achieved 100 % sensitivity. Moreover, the COBAS AmpliScreenTM HIV-1 Test, version 1.5 (Roche) is suitable for detecting prevailing HIV-1 variants. <![CDATA[Genotypes of Leptospira spp. strains isolated from dogs in Buenos Aires, Argentina]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400006&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Leptospirosis is an infectious disease of wide global distribution, which is endemic in Argentina. The objective of this study was to obtain the genetic profiles of Leptospira spp. strains isolated from clinical cases of dogs in the province of Buenos Aires by the multiple-locus variable-number tandem repeat analysis (MLVA). Eight isolated canine strains were genotyped by MLVA, obtaining the identical profile of Leptospira interrogans serovar Canicola Hond Utrecht IV in the strains named Dogy and Mayo. The strains named Bel, Sarmiento, La Plata 4581 and La Plata 5478 were identical to the profile of the genotype of L. interrogans serovar Portlandvere MY 1039.The strain named Avellaneda was identical to the genotype profile of L. interrogans serovar Icterohaemorrhagiae RGA and the strain named SB had the same profile as the L. interrogans serovar Pomona Baires genotype and was similar to the profile of serovar Pomona Pomona genotype. It would be useful to include a larger number of isolates from different dog populations in various provinces of Argentina and to characterize the genetic profiles of the strains circulating in the country. The information obtained will be useful for the control of leptospirosis in the dog population. <![CDATA[Diagnosis of an outbreak of Salmonella Typhimurium in chinchillas (Chinchilla lanigera) by pulsed-field gel electrophoresis]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400007&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Adult chinchillas (Chinchilla lanigera) that had suddenly died in a commercial farm located in La Plata City, Buenos Aires Province, Argentina, in July 2012 were macroscopically, histopathologically, and microbiologically examined. Salmonella enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) was isolated from the liver, spleen, heart, lungs, kidneys and intestines from each of the five animals evaluated. The five strains were susceptible to ampicillin, cephalotin, cefotaxime, nalidixic acid, gentamicin, streptomycin, chloramphenicol, fosfomycin, nitrofurantoin and trimethoprimsulfamethoxazole, and resistant to tetracycline. Each of the five S. Typhimurium isolates was analyzed by XbaI- pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), showing an identical electrophoretic profile with 15 defined bands, which was found to be identical to pattern ARJPXX01.0220 of the PulseNet Argentine National database of Salmonella PFGE patterns. This is the first work describing the postmortem diagnosis of an outbreak of salmonellosis in chinchillas by using molecular methods such as PFGE. <![CDATA[ß-lactamases produced by amoxicillin-clavulanate-resistant enterobacteria isolated in Buenos Aires, Argentina: A new bla<sub>TEM</sub>gene]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400008&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt La resistencia a la combinación de ß-lactámico/inhibidor de ß-lactamasa en enterobacterias es un problema creciente que no ha sido estudiado intensamente en Argentina. En el presente trabajo, 54/843 enterobacterias recolectadas en un hospital universitario de la ciudad de Buenos Aires fueron resistentes a ampicilina-sulbactama, pero se mantuvieron sensibles a las cefalosporinas de segunda y tercera generación. Se analizaron los mecanismos enzimáticos presentes en los aislamientos que también fueron resistentes a amoxicilina-ácido clavulánico (AMC) (18/54). La secuenciación reveló dos variantes diferentes de blaTEM-1, donde blaTEM-1b es el alelo más frecuentemente detectado (10 Escherichia coli, 3 Klebsiella pneumoniae, 2 Proteus mirabilis y 1 Raoultella terrigena), seguidos por blaTEM-1a(1 K. pneumoniae). La resistencia a AMC parece estar asociada principalmente con la hiperproducción de TEM-1 (sobre todo en E. coli) o con la coexpresión con ß-lactamasas tipo OXA-2 y/o SHV (K. pneumoniae y P. mirabilis). Se describió una nueva variante de blaTEM(TEM-163) en un aislamiento de E. coli que presentó una CIM frente a AMC de 16/8 µg/ml. La enzima TEM-163 contiene dos sustituciones de aminoácidos respecto de TEM-1, Arg275Gln y His289Leu. Teniendo en cuenta la alta actividad específica observada y la baja IC50 para el ácido clavulánico, el patrón de resistencia de este aislamiento parece obedecer a la hiperproducción de la nueva variante de la ß-lactamasa de amplio espectro, en lugar de vincularse con un comportamiento similar al de una TEM resistente a inhibidores (IRT).<hr/>Resistance to ß-lactam/ß-lactamase inhibitors in enterobacteria is a growing problem that has not been intensively studied in Argentina. In the present work, 54/843 enterobacteria collected in a teaching hospital of Buenos Aires city were ampicillin-sulbactam-resistant isolates remaining susceptible to second-and third-generation cephalosporins. The enzymatic mechanisms present in the isolates, which were also amoxicillin-clavulanic acid (AMC)-resistant (18/54) were herein analyzed. Sequencing revealed two different variants of blaTEM-1, being blaTEM-1b the most frequently detected allelle (10 Escherichia coli, 3 Klebsiella pneumoniae, 2 Proteus mirabilis and 1 Raoultella terrigena) followed by blaTEM-1a(1 K. pneumoniae). Amoxicillin-clavulanate resistance seems to be mainly associated with TEM-1 overproduction (mostly in E. coli) or co-expressed with OXA-2-like and/or SHV ß-lactamases (K. pneumoniae and P. mirabilis). A new blaTEMvariant (TEM-163) was described in an E. coli strain having an AMC MIC value of 16/8 µg/ml. TEM-163 contains Arg275Gln and His289Leu amino acid substitutions. On the basis of the high specific activity and low IC50 for clavulanic acid observed, the resistance pattern seems to be due to overproduction of the new variant of broad spectrumß-lactamase rather than to an inhibitor-resistant TEM (IRT)-like behavior. <![CDATA[Rich bacterial assemblages from Maritime Antarctica (Potter Cove, South Shetlands) reveal several kinds of endemic and undescribed phylotypes]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400009&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Bacterial richness in maritime Antarctica has been poorly described to date. Phylogenetic affiliation of seawater free-living microbial assemblages was studied from three locations near the Argentinean Jubany Station during two Antarctic summers. Sixty 16S RNA cloned sequences were phylogenetically affiliated to Alphaproteobacteria (30/60 clones), Gammaproteobacteria(19/60 clones), Betaproteobacteria and Cytophaga-Flavobacteriia- Bacteroides (CFB), which were (2/60) and (3/60) respectively. Furthermore, six out of 60 clones could not be classified. Both, Alphaproteobacteria and Gammaproteobacteria, showed several endemic and previously undescribed sequences. Moreover, the absence of Cyanobacteria sequences in our samples is remarkable. In conclusion, we are reporting a rich sequence assemblage composed of widely divergent isolates among themselves and distant from the most closely related sequences currently deposited in data banks. <![CDATA[Physical and chemical methods for eliminating propagules of indigenous mycorrhizal fungi from soil samples]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400010&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt El objetivo de este trabajo fue evaluar métodos para eliminar hongos nativos formadores de micorrizas arbusculares (HMA) o reducir su número en muestras de suelo, sin afectar sus propiedades edáficas y microbiológicas. Se estudió la aplicación de calor húmedo (autoclave), de calor seco (estufa), de hipoclorito de sodio (NaClO) y de formaldehído, en concentraciones entre 100,0 y 3,3 µl/g y 16,7 y 3,3 µl/g, respectivamente. Las semillas de raigrás (Lolium multiflorum Lam.) sembradas en sustratos que recibieron NaClO (100,0-33,3 µl/g) no germinaron y el autoclave incrementó el contenido de fósforo en el sustrato. Estos tratamientos no eliminaron la micorrización por HMA y ambos fueron descartados. En un segundo ensayo se analizaron los tratamientos estufa y formaldehído (10,0 µl/g), asociados o no a la descontaminación de las semillas y a la reinoculación con HMA. Ambos procedimientos redujeron o eliminaron la micorrización por HMA nativos en suelos con 12 a 29 mg/kg de fósforo y permitieron la multiplicación de inóculos de HMA. El tiempo de ventilación de las muestras y los requisitos de seguridad fueron mayores con la aplicación de formaldehído.<hr/>The objective of this work was to evaluate methods to eliminate or reduce the number of indigenous arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) from soil samples without affecting their edaphic or microbiological properties. At an early trial we evaluated moist heat (autoclaving), dry heat (oven), sodium hypochlorite (NaClO) and formaldehyde at a range of 100.0-3.3 µl/g and 16.7-3.3 µl/g respectively. There was no germination in plants of ryegrass (Lolium multiflorum Lam.) sown on substrates receiving NaClO (100.0-33.3 ul/g), whereas autoclaving significantly increased the available soil phosphorous content. Both treatments failed to eradicate AMF colonization at 9 weeks; therefore, they were discarded. In a second trial, oven and formaldehyde (10.0 µl/g) treatments were analyzed to assess the effects of seed decontamination and AMF reinoculation. Both procedures were effective in reducing or eliminating indigenous AMF at a range of soil P availability of 12-29 mg/kg. However, the time between soil treatment and AMF multiplication and safety requirements were greater in the case of formaldehyde application. <![CDATA[Agrobacterium rubi strains from blueberry plants are highly diverse]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400011&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Se estudió la diversidad de una colección de cepas de Agrobacterium rubi aisladas de arándanos provenientes de distintas regiones de la República Argentina estableciendo su grado de heterogeneidad mediante pruebas microbiológicas clásicas y técnicas de biología molecular. Los resultados obtenidos en las pruebas bioquímicas y fisiológicas, así como mediante rep-PCR y RFLP del gen 23S ADNr, demostraron una alta variabilidad intraespecífica, tanto fenotípica como genotípica.<hr/>The diversity of a collection of Agrobacterium rubi strains isolated from blueberries from different regions of Argentina was studied by conventional microbiological tests and molecular techniques. Results from biochemical and physiological reactions, as well as from rep-PCR and RFLP analysis of PCR-amplified 23S rDNA showed high phenotypic and genotypic intraspecific variation. <![CDATA[Networks involving quorum sensing, cyclic-di-GMP and nitric oxide on biofilm production in bacteria]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400012&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Las bacterias forman biopelículas de manera ubicua, y esta característica les otorga una flexibilidad que es resultado, en parte, de una matriz compleja construida según las exigencias de las condiciones ambientales. Aunque los estadios de la formación de las biopelículas bacterianas se conocen con detalle, para entender con profundidad la formación de las biopelículas es deseable un conocimiento mayor de los mecanismos de señalización. Las bacterias detectan cambios en la densidad de población por regulación del quórum y condiciones específicas, empleando señales como el di-GMPc y el óxido nítrico. La importancia del conocimiento de estas vías de señalización radica en que controlan una variedad de funciones, como la formación de biopelículas y la movilidad, y proporcionan a las bacterias beneficios en la colonización del hospedador, la defensa contra competidores y los cambios adversos del entorno. Por la trascendencia que revisten estos aspectos, revisamos aquí las redes de regulación y la conexión de la señalización entre quorum sensing, di-GMPc y óxido nítrico.<hr/>Bacterial biofilms are ubiquitous in nature, and their flexibility is derived in part from a complex extracellular matrix that can be made-to-order to cope with environmental demand. Although common developmental stages leading to biofilm formation have been described, an in-depth knowledge of genetic and signaling is required to understand biofilm formation. Bacteria detect changes in population density by quorum sensing and particular environmental conditions, using signals such as cyclic di-GMP or nitric oxide. The significance of understanding these signaling pathways lies in that they control a broad variety of functions such as biofilm formation, and motility, providing benefits to bacteria as regards host colonization, defense against competitors, and adaptation to changing environments. Due to the importance of these features, we here review the signaling network and regulatory connections among quorum sensing, c-di-GMP and nitric oxide involving biofilm formation. <![CDATA[Microbicides for preventing sexually transmitted infections: Current status and strategies for preclinical evaluation of new candidates]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400013&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Los microbicidas constituyen una nueva herramienta, todavía en proceso de investigación, que podrían ayudar en la prevención de la infección por los virus de la inmunodeficiencia humana (Human immunodeficiency virus: HIV) y de otras infecciones de transmisión sexual (ITS). Una serie de evidencias ha demostrado que la complejidad de la transmisión sexual de patógenos virales requiere de la identificación de compuestos capaces de bloquear los eventos tempranos del ciclo de infección viral. En este manuscrito hacemos una revisión exhaustiva de las diferentes estrategias que se han estudiado o se están considerando para prevenir ITS mediante el uso de microbicidas, haciendo particular énfasis en aquellos con el potencial de bloquear la infección por el HIV. También se revisa el proceso complejo de evaluación preclínica que se requiere para llegar a estudios en humanos y se concluye con un breve análisis de las estrategias que podrían formar parte del futuro inmediato en la investigación de microbicidas.<hr/>Microbicides are a new tool, still under investigation, which could help prevent infection by the human immunodeficiency virus (HIV) and other sexually transmitted infections (STIs). Increasing evidence shows that the complexity of sexual transmission of viral pathogens requires the identification of compounds able to block the early events during the cycle of viral infection. In this manuscript we provide a comprehensive review of the different microbicide strategies that have been studied or are currently being considered for STI prevention, particularly emphasizing those having the potential to block HIV infection. The manuscript also reviews the complex process that is required to conduct future clinical studies in humans and concludes with a brief discussion of the strategies that could be part of the immediate future in microbicide research. <![CDATA[Campylobacter fetus subsp. venerealis adhesion to MDBK cells]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400014&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Los microbicidas constituyen una nueva herramienta, todavía en proceso de investigación, que podrían ayudar en la prevención de la infección por los virus de la inmunodeficiencia humana (Human immunodeficiency virus: HIV) y de otras infecciones de transmisión sexual (ITS). Una serie de evidencias ha demostrado que la complejidad de la transmisión sexual de patógenos virales requiere de la identificación de compuestos capaces de bloquear los eventos tempranos del ciclo de infección viral. En este manuscrito hacemos una revisión exhaustiva de las diferentes estrategias que se han estudiado o se están considerando para prevenir ITS mediante el uso de microbicidas, haciendo particular énfasis en aquellos con el potencial de bloquear la infección por el HIV. También se revisa el proceso complejo de evaluación preclínica que se requiere para llegar a estudios en humanos y se concluye con un breve análisis de las estrategias que podrían formar parte del futuro inmediato en la investigación de microbicidas.<hr/>Microbicides are a new tool, still under investigation, which could help prevent infection by the human immunodeficiency virus (HIV) and other sexually transmitted infections (STIs). Increasing evidence shows that the complexity of sexual transmission of viral pathogens requires the identification of compounds able to block the early events during the cycle of viral infection. In this manuscript we provide a comprehensive review of the different microbicide strategies that have been studied or are currently being considered for STI prevention, particularly emphasizing those having the potential to block HIV infection. The manuscript also reviews the complex process that is required to conduct future clinical studies in humans and concludes with a brief discussion of the strategies that could be part of the immediate future in microbicide research. <![CDATA[Decreased level of consciousness, fever, and dyspnea in an HIV-infected patient]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412014000400015&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Los microbicidas constituyen una nueva herramienta, todavía en proceso de investigación, que podrían ayudar en la prevención de la infección por los virus de la inmunodeficiencia humana (Human immunodeficiency virus: HIV) y de otras infecciones de transmisión sexual (ITS). Una serie de evidencias ha demostrado que la complejidad de la transmisión sexual de patógenos virales requiere de la identificación de compuestos capaces de bloquear los eventos tempranos del ciclo de infección viral. En este manuscrito hacemos una revisión exhaustiva de las diferentes estrategias que se han estudiado o se están considerando para prevenir ITS mediante el uso de microbicidas, haciendo particular énfasis en aquellos con el potencial de bloquear la infección por el HIV. También se revisa el proceso complejo de evaluación preclínica que se requiere para llegar a estudios en humanos y se concluye con un breve análisis de las estrategias que podrían formar parte del futuro inmediato en la investigación de microbicidas.<hr/>Microbicides are a new tool, still under investigation, which could help prevent infection by the human immunodeficiency virus (HIV) and other sexually transmitted infections (STIs). Increasing evidence shows that the complexity of sexual transmission of viral pathogens requires the identification of compounds able to block the early events during the cycle of viral infection. In this manuscript we provide a comprehensive review of the different microbicide strategies that have been studied or are currently being considered for STI prevention, particularly emphasizing those having the potential to block HIV infection. The manuscript also reviews the complex process that is required to conduct future clinical studies in humans and concludes with a brief discussion of the strategies that could be part of the immediate future in microbicide research.