Scielo RSS <![CDATA[Revista argentina de microbiología]]> http://www.scielo.org.ar/rss.php?pid=0325-754120080001&lang=es vol. 40 num. 1 lang. es <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.org.ar/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.ar <![CDATA[Nuevas herramientas para el diagnóstico micológico ¿Contamos con micólogos preparados para usarlas?]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100001&lng=es&nrm=iso&tlng=es <![CDATA[Tipificación molecular de aislamientos de Pseudomonas aeruginosa obtenidos de pacientes con fibrosis quística]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100002&lng=es&nrm=iso&tlng=es La fibrosis quística es la enfermedad genética letal de mayor frecuencia en la población caucásica. La infección pulmonar crónica es la principal causa de morbilidad de la enfermedad, siendo la infección por Pseudomonas aeruginosa la más importante, ya que resulta de difícil erradicación. El Centro de Referencia Provincial de Fibrosis Quística que funciona en el Hospital de Niños "Sor María Ludovica" de La Plata asiste a alrededor de 220 pacientes con fibrosis quística cuyas edades oscilan entre los dos meses y los 45 años. La edad de sobrevida depende de una serie de factores entre los que se encuentran el diagnóstico temprano de la enfermedad y la adquisición de la infección pulmonar crónica por P. aeruginosa. La misma puede adquirirse en forma directa, por transmisión persona a persona o de forma indirecta a través del uso de elementos hospitalarios contaminados. El objetivo de este trabajo fue la tipificación molecular de aislamientos de P. aeruginosa obtenidos de pacientes con fibrosis quística, con el fin de evaluar la relación genómica entre los mismos. El estudio se llevó a cabo mediante RAPD-PCR. El análisis demostró que existe gran heterogeneidad genética entre los aislamientos. La separación en cohortes de pacientes de acuerdo con su bacteriología, que implica la asistencia en días diferentes y las hospitalizaciones en habitaciones aisladas ha demostrado, junto a otras estrategias, disminuir las infecciones cruzadas.<hr/>Cystic fibrosis is the most frequent lethal genetic disease that affects the caucasian population. The main cause of morbidity is the chronic lung infection, being the infection caused by Pseudomonas aeruginosa the most difficult to eradicate. This bacteria can be acquired in direct form, by person-to-person transfer, or indirectly, by hospital acquired infection. The Centro Provincial de Referencia de Fibrosis Quística functioning in the Hospital de Niños "Sor María Ludovica", in La Plata, cares almost 220 patients aged two months to 45 years. The life expectancy depends of factors like the early diagnosis of the disease and the later acquisition of the chronic lung infection. The purpose of this work was the molecular typing of P. aeruginosa isolates obtained from cystic fibrosis patients to evaluate the genomic relationship among them. The study was carried out using RAPD-PCR. The analysis showed a great genetic heterogeneity among the isolates. The separation of the patients in groups in accordance with its bacteriology, that implies the attendance in different days and the implementation of isolation (or segregation) measures had demonstrated to be, in addition to other strategies, effective in the reduction of cross infections. <![CDATA[Análisis in silico de la capacidad de dos técnicas de PCR para la detección del gen stx]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100003&lng=es&nrm=iso&tlng=es Escherichia coli productor de toxina Shiga es un patógeno emergente cuyo principal factor de virulencia son las toxinas Shiga (Stx), codificadas por los genes stx. Estas toxinas se clasifican en 6 tipos (1, 2, 2c, 2d, 2e y 2f) que agrupan a 22 variantes. En Argentina se validaron dos técnicas de PCR para la detección de los genes stx, PCR-MK y PCR múltiple. Los objetivos del trabajo fueron analizar mediante el uso de herramientas bioinformáticas la capacidad de dichas técnicas para detectar las variantes del gen stx y demostrar experimentalmente la amplificación de 8 variantes stx. Se recopilaron 25 secuencias nucleotídicas de la base de datos GenBank correspondientes a 21 variantes de stx. Se utilizó el programa BLAST 2 sequences para analizar la complementariedad de las bases nucleotídicas entre las secuencias de las variantes y las secuencias de los cebadores utilizados en las PCR estudiadas. La técnica de PCR-MK permite detectar los tipos stx1, stx2, stx2c, stx2d y stx2f, aunque no permite detectar el tipo stx2e y tres variantes del tipo stx2c. La PCR múltiple permite detectar los tipos stx1, stx2, stx2c, stx2d, pero no los tipos stx2e y stx2f. Se demostró experimentalmente que ambas técnicas de PCR son apropiadas para la detección de las variantes que están asociadas a enfermedad grave en el hombre.<hr/>Shiga toxin-producing Escherichia coli is an emergent pathogen, being the Shiga toxin (Stx) the main virulence factor. These toxins are classified into 6 types (1, 2, 2c, 2d, 2e and 2f) and 22 variants. In Argentina, two PCR for stx gene detection, PCR-MK and multiplex-PCR, were validated. The aim of this work was to analyze, by using bioinformatic tools, the stx variants that could be amplified by these PCRs, and to experimentally show the amplification of 8 stx variants. Twentyfive nucleotide sequences were collected from GenBank corresponding to 21 stx variants. The BLAST 2 sequences program was used to analyze the complementarities between the nucleotide sequence of the variants and the primers corresponding to the PCR studied. PCR-MK could detect types stx1, stx2, stx2c, stx2d and stx2f, but not type stx2e and three type stx2c variants. On the other hand, the multiplex-PCR could detect types stx1, stx2, stx2c, stx2d, but not stx2e and stx2f types. It was experimentally determined that both PCRs can detect those variants that cause severe disease in humans. <![CDATA[Distribución de serotipos de Streptococcus pneumoniae aislados de infecciones invasoras en el Hospital de Niños de Santa Fe]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100004&lng=es&nrm=iso&tlng=es Con la introducción de vacunas conjugadas antineumocócicas se observó, en muchos países, disminución de aislamientos de Streptococcus pneumoniae del serotipo 14 y aumento de aislamientos correspondientes a serotipos no incluidos en esas vacunas. En 1993, el Hospital de Niños de Santa Fe comenzó la vigilancia de la distribución de serotipos de Streptococcus pneumoniae invasores. En este trabajo se estudió la correlación entre serotipo y a) patología (neumonía/meningitis), b) edad (menor o mayor de dos años), y c) CIM de penicilina, para los serotipos aislados en el período 2003-2005. El serotipo predominante fue el 14, seguido del 1, 6B, 18C, 7F, 19F y 5. El serotipo 14 mostró asociación estadísticamente significativa con valores de CIM de penicilina entre 0,5 y 2 mg/l, no así con alguna patología, aunque se lo halló con mayor frecuencia en neumonías que en meningitis. Los serotipos 14 y 1 prevalecieron en niños menores y mayores de 2 años, respectivamente. La CIM de penicilina = 2 mg/l se observó más en neumonías que en meningitis. La frecuencia relativa de los diferentes serotipos hallados fue semejante a la observada en el período 1993-99; no obstante, los serotipos 18C, 4, 12F y 22F no se habían encontrado antes. La aparición de nuevos serotipos convierte en importante la vigilancia, dada la necesidad de formular vacunas que los incluyan y que efectivamente prevengan las infecciones neumocócicas más comunes.<hr/>The serotype distribution of Streptococcus pneumoniae varies through time. The introduction of pneumococcal conjugate vaccines showed a decreased prevalence of pneumococcal invasive isolates belonging to serotype 14 and an increase of serotypes not therein included. In 1993, the Hospital de Niños of Santa Fe began surveillance of the serotype distribution of invasive S. pneumoniae disease. In the period 2003 - 2005, 76 isolates were analysed by studying the correlation between serotype and pathology, age and MIC of penicillin. Serotype 14 was the most frequent followed by serotypes 1, 6B, 18C, 7F, 19 F and 5. Serotype 14 showed a statistically significant correlation with MICs of penicillin ranging from 0,5 to 2 mg/l. Although this serotype was more frequently observed in pneumonia than in meningitis, there was not a significant association with any particular pathology. Serotypes 14 and 1, were prevalent among children under and over 2 years old, respectively. Most of these isolates with MICs of penicillin = 2 mg/l, were from patients with pneumonia and not with meningitis. The serotype distribution was similar to that during the period 1993-99, with the exception of serotypes 18C, 4, 12F and 22F which had never been found before. The emergence of these serotypes makes it essential to continue surveillance to determine which conjugated vaccine formulation would be suitable to prevent the most frequent pneumococcal invasive infections. <![CDATA[Peritonitis en diálisis peritoneal: características microbiológicas y patrones de infección a lo largo de 15 años en un hospital universitario en Argentina]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100005&lng=es&nrm=iso&tlng=es This study reports the infectious peritonitis rates in 44 patients on peritoneal dialysis in three different systems over the last 15 years, covering clinical outcomes, exit-site infections, tunnel infections, causative microorganisms, and the history of susceptibility of organisms causing peritonitis, in order to establish our center-specific selection of empiric therapy. Two microbiological procedures were herein used: method A, where 100 ml of dialysate were centrifuged and cultured in standard media and into blood-culture bottles; and method B, where 10 ml were directly injected into blood-culture bottles. Swabs from the exit-site or tunnel were taken when purulent drainage was observed. There were 96 episodes of peritonitis during 110.43 patient-years (0.87 episodes/patient-year). Sensitivity of method A was 96.88% (93/96 episodes) versus 81.25% (78/96) of method B (p= 0.001). Gram stain sensitivity was 36.46%. The etiologic agents were 64 (56.64%) gram-positive cocci, 22 (19.47%) gram-negative fermentative rods, 20 (17.7%) gram-negative non fermentative rods, 5 (4.43%) yeasts, 1 (0.88%) micelial fungus, and 1 (0.88%) anaerobic rod. Fifty-five exit-site infections were documented (0.5 episodes/patient-year). Ceftazidime and imipenem showed excellent activity on gram-negative rods. There were 92.3% of methicillin-susceptible Staphylococcus aureus but only 33.3% of methicillin-susceptible coagulase- negative staphylococci; vancomycin was active against 100% of the gram-positive cocci. The clinical outcomes of peritonitis were 73 initial cure, 19 catheter removal and four related deaths. The empiric therapy in our center should be vancomycin plus ceftazidime or imipenem. Once the etiological agent and its susceptibility pattern are known, the deescalating therapy must be applied to avoid the emergence and spread of vancomycin-resistant microorganisms.<hr/>Se comunican las tasas de peritonitis infecciosa de 44 pacientes en tres sistemas diferentes de diálisis peritoneal durante los últimos 15 años. Se evaluaron evolución clínica, infecciones del sitio de salida y del túnel, y los microorganismos causales y su sensibilidad, a fin de seleccionar la mejor terapia empírica para nuestro centro. Se realizaron dos procedimientos microbiológicos, método A: 100 ml del dializado fueron centrifugados y cultivados por métodos convencionales y en frascos para hemocultivo; método B: 10 ml fueron directamente inoculados en frascos para hemocultivo. Los hisopados del sitio de salida y del túnel fueron realizados cuando se observó supuración. Se registraron 96 episodios de peritonitis en 110,43 paciente-años (0,87 episodios/paciente-año). La sensibilidad del método A fue 96,88% versus 81,25% del método B (p = 0,001). La sensibilidad de la coloración de Gram fue 36,46%. La distribución de los agentes etiológicos fue la siguiente: 64 (56,64%) cocos gram-positivos, 22 (19,47%) bacilos gram-negativos fermentadores, 20 (17,7%) bacilos gram-negativos no fermentadores, 5 (4,43%) levaduras, 1 (0,88%) hongo micelial, 1 (0,88%) bacilo anaerobio. Fueron documentadas 55 infecciones del sitio de salida (0,5 episodios/paciente-año). La ceftazidima y el imipenem mostraron una excelente actividad sobre los bacilos gram-negativos. La sensibilidad a meticilina fue de 92,3% para Staphylococcus aureus y 33,3% para estafilococos coagulasa negativos; la vancomicina fue activa frente al 100% de los cocos gram-positivos. La evolución clínica de las peritonitis fue: 73 curas, 19 remociones de catéter y cuatro muertes relacionadas. La terapia empírica en nuestro centro debería ser vancomicina más ceftazidima o imipenem. Una vez conocidos el agente etiológico y su sensibilidad, se debería aplicar la terapia de desescalonamiento para evitar la emergencia y diseminación de microorganismos resistentes a la vancomicina. <![CDATA[Paracoccidioidomicosis en la Provincia de Formosa, Argentina]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100006&lng=es&nrm=iso&tlng=es Durante 2 años, en un estudio de corte trasversal, se estudiaron los pacientes con síntomas compatibles con paracoccidioidomicosis (PCM) que concurrieron al Hospital Central de Formosa. Se seleccionaron 335 enfermos, de los cuales 264 eran varones y 71 mujeres, con edades comprendidas entre los 25 y los 79 años. Se hizo diagnóstico de PCM en 24 pacientes, obteniéndose una prevalencia de 7,16%. Hubo un solo caso femenino. La mayoría (83%) de los pacientes había consumido tabaco por un tiempo mayor a 10 años, el 96% pertenecía al área rural y el 63% de ellos refería una ingesta elevada de alcohol. Se detectaron también un caso de PCM infanto-juvenil y uno de neuroparacoccidioidomicosis. El 100% de las muestras de lesiones muco-cutáneas de pacientes con PCM estudiadas fue positivo. El estudio serológico por inmunodifusión en gel de agar (IDGA) permitió el diagnóstico en 22/249 pacientes estudiados. La PCM es endémica en la provincia de Formosa donde coexiste con otras afecciones con manifestaciones semejantes, por lo que se debe realizar siempre el diagnóstico diferencial.<hr/>Patients with paracoccidioidomycosis (PCM) compatible symptoms who attended Hospital Central de Formosa, were studied during 2 years. Three hundred and thirty five patients were selected, 264 male and 71 female, ages were between 25 and 79 years old. Twenty four patients were diagnosed, the prevalence observed was 7.16%. There was only one female positive case. Most patients (83%) had smoked for more than 10 years, 96% came from a rural area and 63% was alcoholic. Also a case of neuroparacoccidioidomycosis and a juvenile-type PCM case were detected. Specimens of mucocutaneous lesions were 100% positives. Immunodiffusion (IDGA) allowed the diagnostic in 22/249 patients. PCM and others infectious diseases with similar clinical manifestations coexist in Formosa province, for this reason differential diagnostic must be done. <![CDATA[Factores de riesgo asociados a candidemias causadas por múltiples especies]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100007&lng=es&nrm=iso&tlng=es Los episodios de candidemia han aumentado en la última década. Sin embargo, la publicación de casos de candidemias causadas por múltiples especies (CME) es infrecuente. De un total de 155 candidemias diagnosticadas entre 1998 y 2004 en el Hospital de Clínicas de la Universidad de Buenos Aires, se identificaron 7 casos de CME (6 adultos y 1 neonato), cuyos datos clínicos y evolutivos se compararon con 21 casos de candidemias producidas por una única especie de Candida (CUE) en pacientes de similar edad e igual sexo. No se hallaron mayores diferencias clínicas o evolutivas entre los pacientes con CME y CUE; sin embargo, la mediana del tiempo de internación y del tiempo promedio de permanencia de los catéteres venosos centrales con anterioridad a la candidemia (39 y 32 días para los pacientes con CME vs. 18 y 12 días para aquellos con CUE, respectivamente) resultaron ser factores predisponentes relevantes. La duración de la candidemia fue más prolongada en los pacientes con CME que en los afectados por CUE (5 días vs. 1 día). En conclusión, aunque los episodios de CME son menos frecuentes que los causados por una única especie de Candida, factores de riesgo potencialmente controlables como el tiempo de internación y el tiempo de utilización de catéteres venosos centrales tienen mayor importancia en el desarrollo de CME.<hr/>The incidence of fungemia has increased over the past decade. Multiple-species candidemia (MSC) has been infrequently reported. From 1998 to 2004, of 155 patients with diagnosis of candidemia at the Hospital de Clínicas (University of Buenos Aires), seven cases of MSC were identified (6 adults and 1 newborn) and compared with 21 cases of similar age and sex with monomicrobial candidemia. There were no differences in clinical data and outcome, except for the mediana duration of hospital stay (39 days for patients with MSC vs. 18 days for patients with monomicrobial candidemia, the mean time of central venous catheter permanence previous to candidemia (32 days for patients with MSC vs. 12 days for patients with monomicrobial candidemia and the duration of candidemia (5 days for MSC and 1 day for monomicrobial candidemia. In conclusion, although MSC episodes are less common than those caused by monomicrobial candidemia, modifiable risk factors such as duration of hospitalization and central venous catheter permanence account for the development of MSC. <![CDATA[Corredores endémicos: Una herramienta útil para la vigilancia epidemiológica de la influenza]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100008&lng=es&nrm=iso&tlng=es La vigilancia epidemiológica provee información actualizada y oportuna sobre los problemas de salud y sus condicionantes, lo que permite definir acciones de prevención y control. Para la detección de epidemias es útil disponer de corredores endémicos, que indican el número de casos esperados para un cuadro infeccioso en un momento determinado. Con datos de la sección Microbiología del Hospital de Niños "Dr. Pedro de Elizalde" acerca de pacientes internados con diagnóstico de infección respiratoria aguda baja (IRAB) entre el 1/1/96 y el 31/12/2002 se confeccionaron los corredores para influenza A (IA) por semanas epidemiológicas, correspondientes a un período de siete años. En ese período se internaron 10.473 niños con diagnóstico de IRAB y se identificó IA en 411 aspirados nasofaríngeos. Se calcularon la media y el intervalo de confianza de 95% para los límites superior e inferior de incidencia en períodos semanales, y se encontró que el pico estacional ocurre entre las semanas 25 y 32. Al analizar los datos del año 2003, se observó que el pico se produjo antes, entre las semanas 19 y 25, y con valores muy por encima de los esperados para esas semanas. En 2004 aparecen 2 picos, el primero en la semana 20 y sin superar los valores de fluctuación de la parte central de la curva, y el segundo en la semana 26.<hr/>Epidemiological surveillance provides updated information about health problems which allows for the establishment of health policy guidelines. The methods for detecting the epidemic frequency of disease require the systematic collection of data on the occurrence of specific diseases. Influenza has cyclic seasonal peaks and its endemic baseline rates are useful for identifying outbreaks: the comparison between baseline and current data supplies epidemiological evidence related to an ongoing outbreak. The upper and lower incidence curves were traced for the data referring to IA detection in the nasopharyngeal aspirates from children hospitalized for acute lower respiratory tract infection from 1996 to 2002. The arithmetic mean and the 95% confidence interval for upper and lower limits of weekly incidence were calculated. The highest incidence was observed between weeks 25 and 32. When analyzing the prepared endemic corridor, it was observed that the highest detection in 2003 occurred between weeks 19 and 25, whereas two peaks occurred in 2004 , the first starting at week 20, at a lower level than the normal epidemic peak, and the second at week 26. <![CDATA[Brote epidémico de meningitis viral causado por echovirus tipo 4 en la provincia de Misiones]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100009&lng=es&nrm=iso&tlng=es Se realizó un estudio retrospectivo a fin de describir un brote epidémico de meningitis causado por enterovirus, que comprometió a 143 niños de 1 mes a 14 años internados en el Hospital Pediátrico de Posadas (Misiones) con diagnóstico de meningitis aséptica, entre agosto y diciembre de 2005. Se observó un aumento de casos entre las semanas 33 a 50, con un pico máximo entre las semanas 47 y 48, lo que confirmó el brote. La mediana de edad de los niños afectados fue de 8 años y el 55,2% fueron varones. El 80% de los casos se observó entre escolares (5 a 14 años). El promedio del tiempo de internación fue de 4,5 ± 1,7 días, y no se registraron fallecidos. Los LCR se estudiaron mediante examen citoquímico y estudios bacteriológicos y virológicos (aislamiento viral, RT- PCR anidada e identificación molecular mediante secuenciación génica). Los recuentos de células en LCR variaron entre 6 y 5040 células /mm3, el 92% fueron inferiores a 500 células/mm3 y el 43,5% mostró predominio linfocitario. El 56% presentó concentraciones de glucosa normal, con proteínas ligeramente elevadas. El 28% de las muestras estudiadas por cultivo (17/60) mostró efecto citopático, compatible con enterovirus. La RT-PCR anidada permitió detectar enterovirus en un 73% de las muestras (43/59), con 6 casos que se tipificaron como echovirus tipo 4. El índice de positividad al combinar ambas técnicas alcanzó el 83%.<hr/>A descriptive retrospective study was carried out to describe an epidemic outbreak of enteroviral meningitis in Misiones. We reviewed records of 143 children from 1 month to 14 years of age who were hospitalized with aseptic meningitis in the Pediatric Hospital of Posadas from August to December 2005. Increased number of cases was observed between weeks 33 to 50 which reached a maximum peak in weeks 47 and 48, confirming an outbreak. The median of age was 8 years old, 55.2% were males. Eighty percent of cases were in 5 to 14 years old children. The average length of time spent in the hospital was 4.5±1.7 days, no deaths were reported. We performed cell counts, chemical and bacterial studies of CSF, and culture or RT-Nested/PCR for enteroviruses. Isolates were serotyped by RT-PCR amplification and genetic sequencing. Cell counts were from 6 to 5040 cells/mm3. Ninety two percent had less than 500 cells/mm3 and 43.5% had lymphocyte predominance. Glucose levels were normal with slightly elevated protein counts in 56% of cases. Of the cultured samples, 28% (17/60) showed cytopathic effect compatible with enterovirus. RT-n-PCR detected enterovirus in 73% (43/59) of the analyzed CSF. Echovirus type 4 was identified in 6 of them. The positive indicator obtained by combining both techniques was 83% (58/70). <![CDATA[Historia y descripción de Microsporum fulvum, una especie válida del género descubierta en la República Argentina]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100010&lng=es&nrm=iso&tlng=es Se realizó un estudio retrospectivo a fin de describir un brote epidémico de meningitis causado por enterovirus, que comprometió a 143 niños de 1 mes a 14 años internados en el Hospital Pediátrico de Posadas (Misiones) con diagnóstico de meningitis aséptica, entre agosto y diciembre de 2005. Se observó un aumento de casos entre las semanas 33 a 50, con un pico máximo entre las semanas 47 y 48, lo que confirmó el brote. La mediana de edad de los niños afectados fue de 8 años y el 55,2% fueron varones. El 80% de los casos se observó entre escolares (5 a 14 años). El promedio del tiempo de internación fue de 4,5 ± 1,7 días, y no se registraron fallecidos. Los LCR se estudiaron mediante examen citoquímico y estudios bacteriológicos y virológicos (aislamiento viral, RT- PCR anidada e identificación molecular mediante secuenciación génica). Los recuentos de células en LCR variaron entre 6 y 5040 células /mm3, el 92% fueron inferiores a 500 células/mm3 y el 43,5% mostró predominio linfocitario. El 56% presentó concentraciones de glucosa normal, con proteínas ligeramente elevadas. El 28% de las muestras estudiadas por cultivo (17/60) mostró efecto citopático, compatible con enterovirus. La RT-PCR anidada permitió detectar enterovirus en un 73% de las muestras (43/59), con 6 casos que se tipificaron como echovirus tipo 4. El índice de positividad al combinar ambas técnicas alcanzó el 83%.<hr/>A descriptive retrospective study was carried out to describe an epidemic outbreak of enteroviral meningitis in Misiones. We reviewed records of 143 children from 1 month to 14 years of age who were hospitalized with aseptic meningitis in the Pediatric Hospital of Posadas from August to December 2005. Increased number of cases was observed between weeks 33 to 50 which reached a maximum peak in weeks 47 and 48, confirming an outbreak. The median of age was 8 years old, 55.2% were males. Eighty percent of cases were in 5 to 14 years old children. The average length of time spent in the hospital was 4.5±1.7 days, no deaths were reported. We performed cell counts, chemical and bacterial studies of CSF, and culture or RT-Nested/PCR for enteroviruses. Isolates were serotyped by RT-PCR amplification and genetic sequencing. Cell counts were from 6 to 5040 cells/mm3. Ninety two percent had less than 500 cells/mm3 and 43.5% had lymphocyte predominance. Glucose levels were normal with slightly elevated protein counts in 56% of cases. Of the cultured samples, 28% (17/60) showed cytopathic effect compatible with enterovirus. RT-n-PCR detected enterovirus in 73% (43/59) of the analyzed CSF. Echovirus type 4 was identified in 6 of them. The positive indicator obtained by combining both techniques was 83% (58/70). <![CDATA[Patrones de resistencia a antibióticos de enterococos aislados de aguas estuarinas]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100011&lng=es&nrm=iso&tlng=es La llegada al ambiente de bacterias antibiótico-resistentes compromete su calidad higiénico sanitaria. Se analizó la prevalencia de diferentes especies de Enterococcus en aguas del estuario de Bahía Blanca y sus patrones de resistencia a los antibióticos. Se identificaron bioquímicamente 103 aislamientos . Para evaluar la resistencia a antibióticos se implementó la técnica de difusión en agar utilizando discos de vancomicina (Van 30 µg), gentamicina (GenH 120 µg), estreptomicina (StrH 300 µg), teicoplanina (T 30 µg), ampicilina (Am 10 µg) y ciprofloxacina (CIP 5 µg), según normas del Clinical and Laboratory Standards Institute. Se identificaron siete especies de Enterococcus; Enterococcus faecium y Enterococcus faecalis resultaron ser las más frecuentes. El 1,9% de los enterococos presentó resistencia de alto nivel a los aminoglucósidos y no hubo aislamientos con resistencia simultánea a StrH y GenH. El 12,6% de los aislamientos resultó resistente a CIP. No se detectaron resistencias a los glucopéptidos, ni a la Am. El 34% de los aislamientos fue sensible a todos los antibióticos probados. Tradicionalmente, la vigilancia de la dispersión de resistencias bacterianas se realiza con microorganismos de muestras clínicas. Los hallazgos de este trabajo constituyen un dato relevante para el control de cepas resistentes, las que se creían circunscriptas al ámbito hospitalario y que, sin embargo, se encuentran circulando en el ambiente.<hr/>The introduction of antibioticresistant bacteria to the environment, affects its hygienic-sanitary quality. The objective of this work is to study the prevalence and the antibiotic resistance patterns of enterococci species isolated from Bahía Blanca estuarine waters. One hundred and three isolates were biochemically identified as Enterococcus spp. The diffusion technique was implemented, by using disks of: vancomycin (Van 30 µg), gentamicin (GenH 120 µg), streptomycin (StrH 300 µg), teicoplanin (T 30 µg), ampicillin (Am 10 µg) and ciprofloxacin (CIP 5 µg) according to the Clinical and Laboratory Standards Institute. Seven Enterococcus species were identified, being Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis the most frequent. High level resistance to aminoglycosides was shown by 1.9% of the enterococci whereas 12.6% of the isolates were resistant to CIP. No isolates showed simultaneous resistance to StrH and GenH. Neither resistance to glycopeptides nor to Am was detected. Thirty four per cent of the isolates exhibited susceptibility to all antibiotics tested. Surveillance studies on antimicrobial resistance are usually based upon microorganisms isolated from clinical samples. The findings of this work constitute relevant data for the control of resistant strains, which were believed to be circumscribed to the hospital environment, but are also widespread in the natural sites. <![CDATA[Evaluación del molibdato y nitrato sobre bacterias sulfato-reductoras asociadas a procesos de corrosión en sistemas industriales]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100012&lng=es&nrm=iso&tlng=es Se estudió la cinética de crecimiento de bacterias sulfato-reductoras (BSR) y la biotransformación de sulfato a sulfuro de hidrógeno bajo condiciones de laboratorio, para establecer el efecto inhibitorio de sales de molibdato y nitrato de sodio. Los microorganismos estudiados fueron aislados del agua de producción contenida en un sistema de transporte de gas natural, donde se encontraban relacionados con procesos de corrosión influenciada microbiológicamente. Con 5 mM de molibdato se obtuvo una reducción de células libres a niveles no detectables y de seis órdenes de magnitud en las biopelículas, con una disminución del sulfuro de alrededor del 100%. Con 75 mM de nitrato se observó una reducción de cuatro y dos órdenes de magnitud en las células libres y en las adheridas en forma de biopelículas, respectivamente, con una disminución del sulfuro de alrededor del 80%. La reducción de la tasa de corrosión observada sustenta la posibilidad de emplear estas sales como biocidas no convencionales no contaminantes del medio ambiente, para el control y mitigación efectiva de los procesos de biocorrosión interna de tanques de almacenamiento y de líneas de transporte en sistemas industriales de gas natural y petróleo.<hr/>The sulfate-reducing bacteria growth kinetics and the biotransformation of sulfate into hydrogen sulfide were studied under laboratory conditions, using batch and continuous assays to determine the effect of molybdate and nitrate as metabolic inhibitors. The microorganisms were isolated from water coming from a natural gas dehydration plant, where they were associated with Microbiologically Influenced Corrosion (MIC) processes, and later cultured in planktonic and sessile states. The addition of 5 mM molybdate showed a growth reduction to levels of non - detectable floating cells and a six order of magnitude reduction in biofilms, concomitant with a sulfide decrease of around 100% in all cultures inhibited by this compound. The addition of 75 mM nitrate showed a four order of magnitude reduction in free bacterial cells and a two order of magnitude reduction in adhered bacterial cells, respectively, as well as a sulfide decrease of around 80%. The decreased corrosion rate detected suggests that these inorganic salts could be nonconventional biocides for an effective and environmentally non contaminant way of controlling and mitigating internal biocorrosion processes in storage tanks and pipelines in natural gas and petroleum industrial systems. <![CDATA[Proteasas extracelulares de la cepa marina antártica Pseudoalteromonas sp. P96-47]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100013&lng=es&nrm=iso&tlng=es The extracellular protease-production capacity of 33 bacterial isolates taken from marine biotopes in King George Island, Antarctica, was evaluated in liquid cultures. The P96-47 isolate was selected due to its high production capacity and was identified as Pseudoalteromonas sp. The optimal growth temperature was 20 °C and the optimal for protease production was 15 °C. Proteases were purified from culture supernatants, developing a multiple-band profile in zymograms. They were classified as neutral metalloproteases and worked optimally at 45 °C with an Eact of 47 kJ/ mol. Their stability was higher at neutral pH, retaining more than 80% of activity at pH 6-10 after 3 h incubation at 4 °C. After 90 min incubation at 40 and 50 °C, the percentages of residual activities were 78% and 44%. These results contribute to the basic knowledge of Antarctic marine proteases and also help evaluate the probable industrial applications of P96-47 proteases.<hr/>La capacidad productora de proteasas extracelulares de 33 aislamientos bacterianos tomados de biotopos marinos en la Isla Rey Jorge, Antártida, fue evaluada en cultivo líquido. El aislamiento P96-47 fue seleccionado debido a su alta capacidad productora y fue identificado como Pseudoalteromonas sp. La temperatura óptima de crecimiento fue de 20 °C y la de producción de 15 °C. Las proteasas fueron purificadas a partir del sobrenadante de cultivo, y en los zimogramas desarrollaron un perfil de múltiples bandas. Estas proteasas fueron clasificadas como metaloproteasas neutras y se observó que trabajan óptimamente a 45 °C, con una Eact de 47 kJ/ mol. Su estabilidad fue superior a pH neutro y retuvieron más del 80% de su actividad a pH 6-10 después de 3 h de incubación a 4 °C. Luego de 90 min de incubación a 40 y 50 °C, las actividades residuales fueron 78% y 44%, respectivamente. Los resultados que se presentan en este trabajo contribuyen al conocimiento básico de las proteasas marinas antárticas y también a evaluar las probables aplicaciones industriales de las proteasas de P96-47. <![CDATA[Detección de colifagos somáticos como indicadores de contaminación fecal en aguas estuarinas]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412008000100014&lng=es&nrm=iso&tlng=es The appearance of enteric disease outbreaks associated with the use of waters considered bacteriologically suitable, calls for the search of new and more precise indicators. Samples of estuarine water were collected in order to quantify E. coli and E. coli ATCC 13706 somatic coliphages and to compare the usefulness of the latter to detect faecal contamination when the concentration of traditional indicators is not quantifiable. Statistical analyses suggested the division of sampling sites into two groups: group I and group II, according to the minor or major level of faecal pollution respectively registered. In group II a high correlation between the coliphages and E. coli (r: 0.73 p<0.01) was detected. E. coli always exceeded coliphage abundance. In group I, this relationship was statistically significant (r: 0.55 p< 0.05), coliphage counts were higher than those of E. coli and were detected in the absence of the latter. In summary, the use of E. coli ATCC 13706 somatic coliphages is proposed as a complementary tool for the diagnosis of the level of faecal contamination of estuarine waters, especially in areas of low pollution.<hr/>La aparición de brotes de enfermedades víricas entéricas asociadas al uso de aguas bacteriológicamente aptas impone la búsqueda de nuevos y más precisos indicadores de contaminación. Se recolectaron muestras de agua estuarina, donde se cuantificaron simultáneamente la bacteria E. coli y los colifagos somáticos de E. coli ATCC 13706, a fin de evaluar la utilidad de estos últimos para detectar contaminación fecal cuando la concentración de los indicadores tradicionales no es cuantificable. Los resultados estadísticos sugirieron la división de las estaciones de muestreo en dos grupos, I y II, de acuerdo con el menor o mayor nivel de contaminación fecal registrado, respectivamente. En el grupo II se detectó una alta correlación entre los recuentos de colifagos y de E. coli (r: 0,73 p<0,01). Asimismo, en este grupo la abundancia de E. coli siempre superó a la de colifagos. En el grupo I la correlación fue estadísticamente significativa (r: 0,55 p < 0,05), pero de mediana magnitud, los recuentos de colifagos superaron a los de E. coli, y éstos fueron detectados aun en ausencia de la bacteria. En conclusión, los colifagos somáticos de E. coli ATCC 13706 serían una herramienta accesoria en el diagnóstico del nivel de contaminación fecal de aguas estuarinas, sobre todo en áreas donde ésta es baja.