Scielo RSS <![CDATA[Revista argentina de microbiología]]> http://www.scielo.org.ar/rss.php?pid=0325-754120110003&lang=es vol. 43 num. 3 lang. es <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.org.ar/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.ar <![CDATA[Y finalmente... la Revista Argentina de Microbiología impactó]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300001&lng=es&nrm=iso&tlng=es <![CDATA[Evaluación de los sistemas comerciales automatizados VITEK 2 y API 20NE para la identificación de organismos del complejo Burkholderia cepacia aislados de muestras clínicas]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300002&lng=es&nrm=iso&tlng=es Las especies del complejo Burkholderia cepacia (CBC) son capaces de causar infecciones crónicas del tracto respiratorio en pacientes con fibrosis quística y en otros individuos inmunocomprometidos. La mayoría de estas especies exhiben alta resistencia a la terapia antibiótica, lo que genera la necesidad de una detección rápida y precisa para poder implementar estrategias de control adecuadas. En este trabajo se utilizó la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para amplificar el gen recA (PCR-recA), con el fin de identificar microorganismos pertenecientes al CBC. Con este método molecular como referencia, se evaluó la sensibilidad (S) y la especificidad (E) de dos sistemas de identificación comerciales automatizados, VITEK 2 y API 20NE (bioMérieux®), así como también el valor de las pruebas bioquímicas manuales más representativas para la identificación de estos microorganismos. El método VITEK 2 presentó una S del 71,1 % y una E del 100 %; para el método API 20NE, estos valores fueron 69,7 % y 90,2 %, respectivamente. En cuanto a las pruebas fenotípicas manuales, los resultados obtenidos fueron más heterogéneos, lo que posiblemente se deba a que estas bacterias podrían sufrir presión selectiva para sobrevivir en pacientes crónicos y perder factores fenotípicos característicos. La técnica de PCR-recA resultó de fácil implementación, por lo que cabe considerar a esta técnica de identificación como una opción viable, aun en laboratorios de diagnóstico clínico de mediana complejidad.<hr/>Species belonging to the Burkholderia cepacia complex (BCC) are capable of causing chronic respiratory tract infections in patients suffering from cystic fibrosis as wel as in immunocompromised individuals. Most of these species are highly resistant to antibiotic therapy, generating the need for their rapid and accurate detection for the proper treatment and clinical management of these patients. In this wok, the polymerase chain reaction (PCR) technique based on the amplification of the recA gene (PCR-recA) was applied for an accurate identification of bacteria belonging to the BCC. Sensitivity (S) and specificity (E) of two biochemically-based commercial automated systems, API 20NE and VITEK 2 (bioMérieux®), and of the most representative biochemical manual tests for the identification of the Burkholderia cepacia complex were herein evaluated. The commercial systems VITEK 2 and API 20NE showed the following sensitivity and specificity vaues for identification to the species level, S: 71.1 %, E: 100 %, S: 69.7 %, E: 90.2 %, respectively. More complex results were observed for phenotypic manual tests, since BCC bacteria can undergo selective pressure to survive in chronic patients causing the loss of their typical phenotypic characteristics. The PCR-recA technique was easy to implement even in medium-complexity clinical diagnostic laboratories. <![CDATA[Species distribution and susceptibility profile of yeasts isolated from blood cultures: results of a multicenter active laboratory-based surveillance study in Argentina]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300003&lng=es&nrm=iso&tlng=es The Mycology Department of the Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas "Dr. C. Malbrán", conducted the Second National Multicenter Survey on Fungemia due to Yeasts in Argentina. The aim was to obtain updated data of the frequency of the causative species encountered and their in vitro susceptibility to seven antifungal agents. Yeast species were identified by micromorphological and biochemical studies. Antifungal susceptibility testing was performed by the reference microdilution method E.Def 7.1 of the European Committee on Antibiotic Susceptibility Testing (EUCAST). A total of 461 viable yeasts were identified. The most frequent species were: Candida albicans (38.4 %), Candida parapsilosis (26 %), Candida tropicalis (15.4 %) and Candida glabrata (4.3 %). Other uncommon species, such as Candida viswanathii (0.6 %), Candida haemulonii (0.4 %), Candida inconspicua (0.2 %) and Candida fermentati (0.2 %) were also isolated. Among the Candida spp., 5.4 % and 1.6 % were resistant to fluconazole and voriconazole, respectively. Itraconazole and caspofungin were the most efficient agents against all Candida spp. tested (MIC < 1 mg/l). For anidulafungin, 21.6 % of C. parapsilosis showed a MIC value of 4 mg/l. Fluconazole was less active against 53.1 % of Cryptococcus neoformans (MIC &gt; 8 mg/l), 75 % of Trichosporon spp., and 100 % of Rhodotorula spp., Geotrichum candidum, Saccharomyces cerevisiae. The global percentage of mortality was 20 %. The presence of uncommon species reinforces the need for performing continuous laboratory surveillance in order to monitor possible changes, not only in the epidemiological distribution of species, but also in the resistance to antifungal drugs.<hr/>Distribución de especies y perfil de sensibilidad de levaduras aisladas de hemocultivos: resultados de un estudio multicéntrico de vigilancia de laboratorio en Argentina. El Departamento Micología del Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas "Dr. Carlos G. Malbrán" condujo el segundo estudio multicéntrico nacional sobre funge- mias debidas a levaduras. El objetivo fue obtener datos actualizados sobre la distribución de especies y la sensibilidad in vitro frente a siete antifúngicos. Las levaduras fueron identificadas mediante el estudio de la micromorfología y la realización de pruebas bioquímicas. La determinación de la sensibilidad se realizó según el método de referencia E.Def 7.1 del European Committee on Antibiotic Susceptibility Testing (EUCAST). Se identificaron 461 levaduras. Las especies más frecuentes fueron Candida albicans (38,4 %), Candida parapsilosis (26 %), Candida tropicalis (15,4 %) y Candida glabrata (4,3 %). Se aislaron otras especies menos comunes, como Candida viswanathii (0,6 %), Candida haemulonii (0,4 %), Candida inconspicua (0,2 %) y Candida fermentati (0,2 %). Entre las especies del género Candida, el 5,4 % y el 1,6 % fueron resistentes al fluconazol y al voriconazol, respectivamente. El itraconazol y la caspofungina fueron los antifúngicos más eficaces in vitro frente a las especies de Candida evaluadas (CIM < 1 mg/l). Para la anidulafungina, el 21,6 % de los aislamientos de C. parapsilosis mostraron una CIM de 4 mg/l. El fluconazol fue menos activo para el 53,1 % de los aislamientos de Cryptococcus neoformans (CIM &gt; 8 mg/l), el 75 % de los aislamientos de Trichosporon spp. y el 100 % de los aislamientos de Rhodotorula spp., Geotrichum candidum y Saccharomyces cerevisiae. El porcentaje de mortalidad fue del 20 %. La presencia de especies infrecuentes refuerza la necesidad de realizar la continua vigilancia de laboratorio con el fin de monitorear posibles cambios, no solo en la epidemiología de las especies causantes de fungemia, sino también en la resistencia a los antifúngicos. <![CDATA[Detección del gen codificante de la metalo-ß-lactamasa VIM-2 en un integrón de clase 1 asociado con el gen bla<sub>CTX-M-2</sub> en un aislamiento clínico de Pseudomonas aeruginosa en el Uruguay: primera comunicación]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300004&lng=es&nrm=iso&tlng=es Con el fin de analizar la presencia de metalo-ß-lactamasas en nuestro medio, se incluyeron en este estudio aislamientos de Pseudomonas aeruginosa causantes de infecciones nosocomiales en un centro hospitalario del Uruguay, en el período comprendido entre abril y setiembre de 2008. En un aislamiento se detectó la presencia del gen codificante de la metalo-ß-lactamasa VIM-2 asociado a un integrón de clase 1 y del gen codificante de una ß-lactamasa de espectro extendido CTX-M-2. Esta es la primera comunicación de la presencia de los genes blaCTX-M-2 y blaVIM-2 en un mismo aislamiento de P. aeruginosa. A pesar de que las carbapenemasas ya han sido ampliamente documentadas en varias partes del mundo, esta es la primera comunicación de una metalo-ß-lactamasa adquirida con actividad carbapenemasa en bacterias patógenas encontradas en el Uruguay.<hr/>VIM-2 metallo-ß-lactamase gen detection in a class 1 integron associated to blaCTX-M-2 in a Pseudomonas aeruginosa clinical isolate in Uruguay: first communication. In order to analyze the presence of metallo-ß-lactamase in our country, we included in this study Pseudomonas aeruginosa isolates causing nosocomial infections in a hospital from Uruguay. The presence of a metallo-ß-lactamase VIM-2 in a class 1 integron and of an extended spectrum -lactamase CTX-M-2 was detected in one isolate. This is the first report of both genes, blaCTX-M-2 and blaVIM-2,in the same P. aeruginosa isolate. Although carbapenemases have been extensively documented in the world, this is the first report of an acquired metallo-ß-lactamase with carbapenemase activity in pathogenic bacteria in Uruguay. <![CDATA[Predictibilidad de la propagación espacial y temporal de la epidemia de influenza A H1N1 en la Argentina por el método de percolación]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300005&lng=es&nrm=iso&tlng=es La epidemia de influenza A H1N1 se expandió rápidamente a nivel mundial dadas las actuales condiciones de alta interconectividad y velocidad de los transportes, imperantes tanto entre las personas como entre los países y las regiones. La diseminación espacial de la epidemia puede ser explicada mediante la teoría de la percolación, que permite estimar un umbral más allá del cual se produce el traspaso de la epidemia entre distintas regiones geográficas. El objetivo de este trabajo fue probar la capacidad predictiva del modelo de percolación aplicado al análisis de la epidemia de influenza A H1N1 registrada en la Argentina en 2009, de acuerdo a los datos relevados por el Ministerio de Salud Pública de la Nación. Para aplicar el mencionado modelo se consideró al país como un conjunto de figuras geométricas irregulares, contiguas y continuas, que pueden representarse en dos dimensiones en una carta geográfica plana. Se analizó la proporción de provincias infectadas en el momento de la percolación con respecto al tiempo y se compararon los valores observados con los esperados mediante ecuaciones de estimación curvilínea en un modelo logístico. La percolación ocurrió en el día 45. El valor esperado que generó el modelo fue de 42,4 días, intervalo de confianza de 95 % 28,5-56,3. La diferencia entre el valor observado y el esperado arrojó un valor de p = 0,997. Se concluye que el modelo posee un buen ajuste y una adecuada capacidad predictiva.<hr/>Spatial and temporal spread predictability of influenza A H1N1 epidemic in Argentina by the percolation method. The influenza A H1N1 epidemic has spread rapidly worldwide on account of the current conditions of high interconnectivity and transport speed both among people and countries. The spatial spread of the epidemics can be explained by the percolation theory which allows to estimate a threshold beyond which the transmission of the infection among different geographic regions occurs. The aim of this study was to test the predictive ability of the percolation model of influenza A H1N1 epidemic in Argentina according to data gathered by the National Department of Public Health. In the model, the country was considered as a set of irregular, contiguous and continuous geometric figures, which can be represented in two dimensions on a plane. We analyzed the proportion of infected provinces at the moment of percolation in relation to time in days and compared observed and expected values by curvilinear equations in a logistic model. Percolation occurred on day 45. The expected value generated by the model was 42.4 days, 95 % CI 28.5 to 56.3. The difference between observed and expected values was p = 0.997. We conclude that the model has good fit and predictive capacity. <![CDATA[Diagnóstico bacteriológico de tuberculosis renal: experiencia del Laboratorio Regional de Tuberculosis de la provincia de Córdoba]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300006&lng=es&nrm=iso&tlng=es Dada la considerable incidencia de tuberculosis renal entre enfermos con tuberculosis pulmonar, nos propusimos estudiar la frecuencia de esta asociación en pacientes atendidos en centros de salud públicos y privados de Córdoba a lo largo del período 1997-2009. Se tomó en consideración la incidencia según el sexo y las especies del complejo Mycobacterium tuberculosis identificadas. El análisis de 948 muestras de orina de 383 pacientes indicó tuberculosis renal en 24 casos (6,3 %), con presencia mayoritaria de Mycobacterium tuberculosis (95,8 %) y presencia de Mycobacterium bovis en 4,2 % de los casos. La asociación tuberculosis renal-tuberculosis pulmonar activa se encontró en 6 casos. En esta investigación quedó demostrada la importancia del cultivo seriado de muestras de orina y la conveniencia de cultivar en medios sólidos y líquidos. Asimismo, el aislamiento de Mycobacterium bovis pone de relieve la importancia de usar el medio Stonebrink junto con el medio de Lowenstein-Jensen. El medio líquido no tuvo un aporte significativo al diagnóstico de tuberculosis renal; sin embargo, el cultivo de muestras seriadas aumentó la sensibilidad de la detección.<hr/>Bacteriological diagnosis of renal tuberculosis: an experience at the Regional Tuberculosis Laboratory in Córdoba province, Argentina. Given the incidence of renal tuberculosis in patients suffering of pulmonary tuberculosis, we seek to study both the frequency of this association in diagnosed cases of renal tuberculosis and the Mycobacterium tuberculosis complex species that were identified (period 1997-2009), observing its incidence by sex, demonstrating the importance of serial culture of urine samples and evaluating the convenience of using solid and liquid media. The analysis of urine samples from 383 patients indicated renal tuberculosis in 24 cases; in most cases, (95.8 %) Mycobacterium tuberculosis complex species prevailed, whereas the presence of Mycobacterium bovis accounted for 4.2 % of the cases. The association of pulmonary and renal tuberculosis was found in 6 cases. The isolation of Mycobacterium bovis indicates the importance of including Stonebrink medium along with Lowenstein- Jensen medium. The liquid medium made no significant contribution to the diagnosis of renal tuberculosis, but indeed, cultivating serial samples increases sensitivity. <![CDATA[Antibiotic prescription in intensive care units in Latin America]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300007&lng=es&nrm=iso&tlng=es The intensive care units (ICUs) are often considered as the epicenters of antibiotic resistance. Therefore, the total antibiotic consumption is approximately ten fold greater in ICU wards than in general hospital wards. The aim of this study was to evaluate the current use of antibiotics in Latin American ICUs. Three cross-sectional (one-day point) prevalence studies were undertaken in 43 Latin American ICUs. Of 1644 patients admitted, 688 received antibiotic treatment on the days of the study (41.8 %) and, 392 cases (57 %) were due to nosocomial-acquired infections. Of all infections, 22 % (151/688) corresponded to septic shock; and 22 % (151/688) to nosocomial pneumonia (50/151 [33 %], ventilator-associated pneumonia). In 485 patients (70.5 %), cultures were performed before starting antibiotic treatment. The most common microorganisms isolated were extended-spectrum ß-lactamase Enterobacteriaceae, (30.5 %), and Pseudomonas aeruginosa (17 %). Carbapenems (imipenem or meropenem) were the antibiotics most frequently prescribed (151/688, 22 %), followed by vancomycin (103/688, 15 %), piperacillin-tazobactam (86/688, 12.5 %) and broad-spectrum cephalosporins (mainly cefepime) (83/688, 12 %). In summary, carbapenems were the most frequent antibiotics prescribed in Latin American ICUs. This practice seems justified for the high rates of ESBL-producing Gram-negatives found in our patients. Beyond this reason, the problem of bacterial resistance in LA requires that physicians improve the use of carbapenems. The high prevalence of carbapenem-resistant A. baumannii and P. aeruginosa in the region, along with the prevalence of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae, have increased markedly. A comprehensive evidence-based stewardship program based on local antimicrobial use and resistance problems should be implemented in our clinical settings.<hr/>Prescripción de antibióticos en unidades de cuidados intensivos de Latinoamérica. Las unidades de cuidados intensivos (UCI) son a menudo consideradas el epicentro de la resistencia a los antibióticos. En este sentido, el consumo total de antibióticos es aproximadamente diez veces mayor en las UCI que en las salas de internación general. El objetivo de este estudio fue evaluar el hábito prescriptivo de antibióticos en las UCI de varios países de Latinoamérica. A tal fin, se realizó un estudio transversal con tres evaluaciones puntuales de un día de duración cada una, para determinar la prevalencia del uso de antibióticos en las 43 UCI ubicadas en distintos países del continente americano. De los 1644 pacientes admitidos, 688 estaban recibiendo tratamiento antibiótico en los días en que se realizó el relevamiento (41,8 %), en 392 casos (57 %), debido a infecciones nosocomiales. De todas las infecciones, 22 % (151/688) correspondieron a shock séptico y 22 % (151/688) a neumonía nosocomial (de estas últimas, el 33 % [50/151] fueron neumonías asociadas a ventilación mecánica). En 485 pacientes (70,5 %) se obtuvieron cultivos antes del inicio del tratamiento antibiótico. Entre los aislamientos, los microorganismos más comúnmente aislados fueron las enterobacterias productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) (30,5 %) y Pseudomonas aeruginosa (17 %). Los carbapenems (imipenem o meropenem) fueron los antibióticos prescriptos con mayor frecuencia (151/688, 22 %), seguidos por la vancomicina (103/688, 15 %), la piperacilina-tazobactama (86/688, 12,5 %) y las cefalosporinas de amplio espectro (principalmente cefepima) (83/688, 12 %). En conclusión, los carbapenems fueron los antibióticos más frecuentemente prescriptos en las UCI de los países latinoamericanos evaluados. Esta práctica podría estar justificada por las altas tasas de enterobacterias productoras de BLEE halladas en los pacientes de esas regiones. Más allá de esta razón, el problema de la resistencia bacteriana en muchos países del continente requiere que los médicos optimicen el uso de los carbapenems, ya que la prevalencia de aislamientos resistentes a este grupo de antimicrobianos se ha incrementado marcadamente, tanto en A. baumannii y P. aeruginosa como en enterobacterias. Frente a este panorama, en todos estos países se torna necesario implementar programas de optimización del uso de antibióticos, basados en la epidemiología y en las tasas de resistencia locales. <![CDATA[Queratopatía cristalina: diagnóstico clínico y microbiológico de una infección corneal infrecuente causada por el grupo Streptococcus mitis]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300008&lng=es&nrm=iso&tlng=es El objetivo del presente informe es describir un caso de queratopatía cristalina causada por microorganismos pertenecientes al grupo Streptococcus mitis en una paciente que concurrió a la consulta oftalmológica por molestias en su ojo derecho. Al examen oftalmológico presentó un punto de sutura interrumpida de nylon 10-0 sin tensión y con secreciones mucosas adheridas. El punto flojo fue retirado bajo normas de asepsia. Se indicó colirio de moxifloxacina al 0,5 %; el ojo tuvo una evolución adecuada, con una correcta epitelización. Sin embargo, luego de 15 días desarrolló un infiltrado blanquecino arboriforme. Se tomó una muestra en el quirófano, enhebrando el trayecto intraestromal de la sutura retirada con sutura de vicryl 7-0. Se indicaron colirios de vancomicina con 50 mg/ml. El infiltrado se mantuvo estable durante 45 días, luego se incrementó el tamaño y se produjo necrosis tisular con peligro de perforación corneal. Se realizó un recubrimiento conjuntival bipediculado. La paciente evolucionó favorablemente y luego de la retracción espontánea del recubrimiento, se observó leucoma cicatrizal y neovasos corneales.<hr/>Crystalline keratopathy: an infrequent corneal infection produced by the Streptococcus mitis group. The objective of this report is to describe a case of crystalline keratopathy caused by the Streptococcus mitis group corresponding to a patient who attended hospital for discomfort in his right eye. The ophthalmological examination showed an interrupted stitch of 10-0 nylon suture without tension and with attached mucus secretions. The loose suture was removed under aseptic conditions. Moxifloxacin 0.5 % eye drops were topically indicated. The treated eye successfully epithelialized and evolved favorably. However, after 15 days, a white tree-shaped infiltrate developed. A corneal sample was taken in the operating room, threading the intrastromal path of the removed stitch with a 7-0 vicryl suture. Vancomycin 50 mg/ml drops were indicated. The infiltrate, which was stable for 45 days, later increased its size and tissue necrosis occurred with danger of corneal perforation. A bipedicle conjunctival flap was performed in the affected corneal area, which evolved favorably. After spontaneous conjunctival flap retraction, only corneal scarring and neovascularization outside the visual axis were observed. <![CDATA[Phenotypic and genotypic characterization of Streptococcus uberis isolated from bovine subclinical mastitis in Argentinean dairy farms]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300009&lng=es&nrm=iso&tlng=es The aim of this study was to investigate the phenotypic and genotypic characteristics of Streptococcus uberis isolated from subclinical mastitis (SCM) cases, and to examine the possible association between both characteristics. A total of 32 S. uberis were isolated from 772 quarter milk samples (SCM > 250,000 cells/ml) collected from 195 cows selected randomly from 18 dairy farms located in Argentina. The S. uberis strains were characterized phenotypically by the presence of virulence factors as plasminogen activator factor (PAF), hyaluronidase (HYA), capsule (CAP) and CAMP factor, and were further characterized genotypically by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). S. uberis strains expressed plasminogen activator factor, hyaluronidase or capsule (65.5 %, 56.3 %, 59.4 %, respectively), but only 25 % of isolates were CAMP factor positive. Thirteen different virulence profiles were identified on the basis of the combination of virulence factors. Eighteen PFGE patterns with 90% of similarity were identified among 32 S. uberis. A great diversity of virulence profiles and PFGE patterns were present among dairy farms. S. uberis strains with the same PFGE pattern showed different virulence profiles. Bovine S. uberis strains causing SCM included in the present study showed heterogeneity in regard to their phenotypic and genotypic characteristics, and the PFGE patterns are not associated with the virulence profiles.<hr/>Caracterización fenotípica y genotípica de Streptococcus uberis aislados de mastitis bovina subclínica en tambos de Argentina. El objetivo de este estudio fue investigar las características fenotípicas y genotípicas de Streptococcus uberis aislados de casos de mastitis subclínica (MSC) y examinar la posible asociación entre ambas características. Un total de 32 cepas de S. uberis fueron aisladas de 772 muestras de leche de cuartos mamarios (MSC > 25 0000 células/ml) colectadas de 195 vacas seleccionadas al azar pertenecientes a 18 tambos lecheros localizados en Argentina. Las cepas de S. uberis fueron caracterizadas fenotípicamente sobre la base de la presencia de factores de virulencia tales como el factor activador del plasminógeno (FAP), la hialuronidasa (HIA), la cápsula (CAP) y el factor CAMP. Además, fueron caracterizadas genotípicamente por electroforesis de campos pulsados (PFGE). Las cepas de S. uberis expresaron el factor activador del plasminógeno, la hialuronidasa o la cápsula (65,5 %, 56,3 % y 59,4 %, respectivamente), pero solo el 25 % fueron CAMP positivas. Sobre la base de la combinación de los factores de virulencia se identificaron 13 perfiles de virulencia diferentes. Asimismo, se identificaron 18 patrones de PFGE con un 90 % de similitud entre las 32 cepas de S. uberis. Se presentó una gran diversidad de perfiles de virulencia y patrones de PFGE entre los tambos. Cepas con el mismo patrón de PFGE presentaron perfiles de virulencia diferentes. Las cepas de S. uberis causantes de MSC en bovinos incluidas en el presente estudio mostraron heterogeneidad con respecto a sus características fenotípicas y genotípicas, y los patrones de PFGE no estuvieron asociados con los perfiles de virulencia. <![CDATA[Optimization of biomass production of a mutant of Yarrowia lipolytica with an increased lipase activity using raw glycerol]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300010&lng=es&nrm=iso&tlng=es The yeast Yarrowia lipolytica accumulates oils and is able to produce extracellular lipases when growing in different carbon sources including glycerol, the principal by-product of the biodiesel industry. In this study, biomass production of a novel mutant strain of Y. lipolytica was statistically optimized by Response Surface Methodology in media containing biodiesel-derived glycerol as main carbon source. This strain exhibited distinctive morphological and fatty acid profile characteristics, and showed an increased extracellular lipase activity. An organic source of nitrogen and the addition of 1.0 g/l olive oil were necessary for significant lipase production. Plackett-Burman and Central Composite Statistical Designs were employed for screening and optimization of fermentation in shaken flasks cultures, and the maximum values obtained were 16.1 g/l for biomass and 12.2 Units/ml for lipase, respectively. Optimized batch bioprocess was thereafter scaled in aerated bioreactors and the values reached for lipase specific activity after 95 % of the glycerol had been consumed, were three-fold higher than those obtained in shaken flasks cultures. A sustainable bioprocess to obtain biomass and extracellular lipase activity was attained by maximizing the use of the by-products of biodiesel industry.<hr/>Optimización de la producción de biomasa usando glicerol crudo, de una cepa mutante de Yarrowia lipolytica con actividad incrementada de lipasa. La levadura Yarrowia lipolytica acumula aceites y produce una lipasa extracelular al crecer en diferentes fuentes de carbono, entre ellas el glicerol, principal subproducto de la creciente industria del biodiésel. En el presente trabajo, se optimizó mediante la metodología de superficies de respuesta la producción de biomasa de una nueva cepa mutante de Y. lipolytica, empleando medios con glicerol derivado de la industria del biodiésel como principal fuente de carbono. Esta cepa presentó características morfológicas y perfil de ácidos grasos distintivos, y una mayor actividad de lipasa extracelular. Para obtener una producción significativa de lipasa extracelular, fue necesario el agregado de una fuente orgánica de nitrógeno y de 1 g/l de aceite de oliva. Se utilizaron los diseños estadísticos de Plackett-Burman y central compuesto para la selección y la optimización de las fermentaciones en frascos agitados; los máximos valores de biomasa y de lipasa obtenidos fueron de 16,1 g/l y 12,2 unidades/ml, respectivamente. Luego, el bioproceso en lote optimizado se escaló a biorreactores aireados, y los valores de actividad específica de lipasa alcanzados después de haberse consumido el 95 % del glicerol fueron tres veces más altos que los obtenidos en los cultivos en frascos agitados. En suma, se desarrolló un bioproceso sostenible para la obtención de biomasa y de una actividad de lipasa extracelular, que a la vez maximiza el uso de subproductos de la industria del biodiésel. <![CDATA[Xanthophyllomyces dendrorhous (Phaffia rhodozyma) on stromata of Cyttaria hariotii in northwestern Patagonian Nothofagus forests]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300011&lng=es&nrm=iso&tlng=es The occurrence and distribution of Xanthophyllomyces dendrorhous associated with Cyttaria hariotii parasitizing three Nothofagus species (N. dombeyi, N. antarctica and N. pumilio) in northwestern Patagonia (Argentina), as well as the factors that may affect this distribution were herein studied. Between 2000 and 2007, samples were obtained from 18 different locations. Based on physiological tests and morphological characteristics of sexual structures, 72 isolates were identified as X. dendrorhous. Representative strains were studied by MSP-PCR fingerprinting and sequence analysis of the ITS region. MSP-PCR fingerprints were similar for the newly isolated strains, and were also identical to the profiles of the strains previously found in this region. Patagonian strains appear to be a genetically uniform and distinct population, supporting the hypothesis that the association with different host species has determined genetically distinct X. dendrorhous populations worldwide. X. dendrorhous was recovered from N. dombeyi and N. antarctica. Approximately half the sampling sites and samples were positive for X. dendrorhous, but the isolation recovery rate was low. X. dendrorhous was absent in the early stages of ascostromata maturation, becoming more abundant in later stages. The present work represents a step forward in the understanding of the natural distribution and ecology of this biotechnologically relevant yeast.<hr/>Xanthophyllomyces dendrorhous (Phaffia rhodozyma) asociado a estromas de Cyttaria hariotii en bosques de Nothofagus en el noroeste de la Patagonia. Se estudió la ocurrencia y la distribución de Xanthophyllomyces dendrorhous asociado a Cyttaria hariotii en tres especies de Nothofagus (N. dombeyi, N. antarctica y N. pumilio) del noroeste de la Patagonia (Argentina), y los factores que podrían afectar esta distribución. El muestreo se realizó entre 2000 y 2007 en 18 sitios diferentes. Según las pruebas fisiológicas y las características morfológicas de las estructuras sexuales, 72 de los aislamientos obtenidos se identificaron como X. dendrorhous. Se estudiaron cepas representativas mediante la técnica de MSP-PCR fingerprinting y secuenciación de la región ITS. Los perfiles de MSP-PCR fueron similares, tanto entre los nuevos aislamientos como entre estos y los de cepas previamente obtenidas en la región. Aparentemente, las cepas patagónicas forman una población genéticamente uniforme y distinta de otras poblaciones. Esto apoya la hipótesis de que la asociación con diferentes especies hospedadoras ha determinado la diferenciación genética de X. dendrorhous en todo el mundo. X. dendrorhous se recuperó de N. dombeyi y de N. antarctica. Aproximadamente la mitad de los sitios de muestreo y de muestras fueron positivos para X. dendrorhous, pero la tasa de aislamiento fue muy baja. X. dendrorhous está ausente en estadios tempranos de maduración de ascostromas y se hace más abundante en estadios más tardíos. El presente trabajo contribuye al mejor entendimiento de la distribución natural y la ecología de esta levadura, de relevancia biotecnológica. <link>http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-75412011000300012&lng=es&nrm=iso&tlng=es</link> <description>The occurrence and distribution of Xanthophyllomyces dendrorhous associated with Cyttaria hariotii parasitizing three Nothofagus species (N. dombeyi, N. antarctica and N. pumilio) in northwestern Patagonia (Argentina), as well as the factors that may affect this distribution were herein studied. Between 2000 and 2007, samples were obtained from 18 different locations. Based on physiological tests and morphological characteristics of sexual structures, 72 isolates were identified as X. dendrorhous. Representative strains were studied by MSP-PCR fingerprinting and sequence analysis of the ITS region. MSP-PCR fingerprints were similar for the newly isolated strains, and were also identical to the profiles of the strains previously found in this region. Patagonian strains appear to be a genetically uniform and distinct population, supporting the hypothesis that the association with different host species has determined genetically distinct X. dendrorhous populations worldwide. X. dendrorhous was recovered from N. dombeyi and N. antarctica. Approximately half the sampling sites and samples were positive for X. dendrorhous, but the isolation recovery rate was low. X. dendrorhous was absent in the early stages of ascostromata maturation, becoming more abundant in later stages. The present work represents a step forward in the understanding of the natural distribution and ecology of this biotechnologically relevant yeast.<hr/>Xanthophyllomyces dendrorhous (Phaffia rhodozyma) asociado a estromas de Cyttaria hariotii en bosques de Nothofagus en el noroeste de la Patagonia. Se estudió la ocurrencia y la distribución de Xanthophyllomyces dendrorhous asociado a Cyttaria hariotii en tres especies de Nothofagus (N. dombeyi, N. antarctica y N. pumilio) del noroeste de la Patagonia (Argentina), y los factores que podrían afectar esta distribución. El muestreo se realizó entre 2000 y 2007 en 18 sitios diferentes. Según las pruebas fisiológicas y las características morfológicas de las estructuras sexuales, 72 de los aislamientos obtenidos se identificaron como X. dendrorhous. Se estudiaron cepas representativas mediante la técnica de MSP-PCR fingerprinting y secuenciación de la región ITS. Los perfiles de MSP-PCR fueron similares, tanto entre los nuevos aislamientos como entre estos y los de cepas previamente obtenidas en la región. Aparentemente, las cepas patagónicas forman una población genéticamente uniforme y distinta de otras poblaciones. Esto apoya la hipótesis de que la asociación con diferentes especies hospedadoras ha determinado la diferenciación genética de X. dendrorhous en todo el mundo. X. dendrorhous se recuperó de N. dombeyi y de N. antarctica. Aproximadamente la mitad de los sitios de muestreo y de muestras fueron positivos para X. dendrorhous, pero la tasa de aislamiento fue muy baja. X. dendrorhous está ausente en estadios tempranos de maduración de ascostromas y se hace más abundante en estadios más tardíos. El presente trabajo contribuye al mejor entendimiento de la distribución natural y la ecología de esta levadura, de relevancia biotecnológica.</description> </item> </channel> </rss> <!--transformed by PHP 01:11:52 20-11-2014-->