Scielo RSS <![CDATA[BAG. Journal of basic and applied genetics]]> http://www.scielo.org.ar/rss.php?pid=1852-623320140003&lang=es vol. 25 num. 2 lang. es <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.org.ar/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.ar <![CDATA[Autopolinización y su implicancia en la invasividad de Helianthus annuus ssp. annuus Y H. Petiolaris]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332014000300001&lng=es&nrm=iso&tlng=es Helianthus petiolaris and H. annuus are exotic invaders that have spread widely in central Argentina in the last 70 years. As other annuals of the same genus, these species are outcrossers bearing a sporophytic self-incompatible mechanism. We investigated the ability to self-pollinate in plants of five accessions of each species, its influence on some reproductive traits, and compared to the cultivated sunflower, in which breeding for self-compatibility has been very successful. Plants were allowed to self-pollinate in bagged heads, manually forced to self-pollinate or allowed to cross-pollinate. Although both invasive species were confirmed as self-incompatible, some plants within most accessions were able to self-pollinate. There was no significant interaction between accessions and pollination type for most traits, except for seed set which was attributed to interspecific introgression. The self-compatibility of some plants was transmitted to their progeny. No significant correlation between self-pollination and spread distance from the proposed entry point for the exotic species was found. The occurrence of self-compatible plants was demonstrated in both species and this fact could in part explain the high invasive ability of annual Helianthus species in Argentina.<hr/>Helianthus petiolaris y H. annuus son invasores exóticos que se han extendido en el centro de Argentina en los últimos 70 años. Como otras anuales del mismo género, estas especies son de polinización cruzada y llevan un mecanismo de auto-incompatibilidad esporofítica. Se investigó la capacidad de auto-polinización en plantas de cinco colecciones de cada especie, su influencia sobre algunos aspectos reproductivos y en comparación con el girasol cultivado, en el que el mejoramiento para la auto-compatibilidad ha sido exitoso. Las plantas se auto-polinizaron con los capítulos tapados por bolsas, se auto-polinizaron de manera forzada manualmente o se permitió la polinización cruzada. Aunque ambas especies invasoras fueron confirmadas como auto- incompatibles, algunas plantas dentro de la mayoría de las colecciones fueron capaces de auto-polinizarse. No hubo interacción significativa entre las colecciones y el tipo de polinización para la mayoría de los rasgos, excepto para la producción de semillas que se debió a la introgresión interespecífica. La auto-compatibilidad de algunas plantas se transmitió a su descendencia. No se encontró una correlación significativa entre la auto-polinización y la distancia de propagación desde el punto de entrada propuesto para las especies exóticas. La aparición de las plantas auto-compatibles se demostró en ambas especies y este hecho podría explicar en parte la alta capacidad invasiva de las especies anuales Helianthus en Argentina. <![CDATA[Fenotipos morfológicos, viabilidad del polen y relaciones polen-pistilo en tres poblaciones naturales de la papa silvestre Solanum chacoense bitter]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332014000300002&lng=es&nrm=iso&tlng=es Argentina is center of diversity of approximately 35 wild taxonomic potato species that have wide geographical distribution. These species, which form polyploid series with 2n=2x=24 up to 2n=6x=72 (x=12), can reproduce both sexually and asexually. Most of them are diploid obligate outcrossers because they possess a one-locus gametophytic self-incompatibility system. In nature, wild potatoes can present both external and internal reproductive isolation barriers, within and between populations, which can be incomplete. Most accessions in germplasm banks have been assigned specific categories based on morphological phenotypes (taxonomic species concept), without taking into account the natural reproductive behavior of the sampled populations. One of these species, Solanum chacoense Bitter (2n=2x=24, 2 EBN 1), spontaneously grows from the NW provinces to SE Buenos Aires province, in very diverse habitats and overlapping with other taxonomic potato species, with which it can spontaneously hybridize. As preliminary activities of an in situ study, individual plants from three populations classified as S. chacoense (APEC-1, APEC-2 and APEC-3) that spontaneously grow in Balcarce, Buenos Aires province, were characterized for morphological phenotypes of leaves, flowers and fruits, pollen viability and pollen-pistil relations. The percentage of pollen viability (determined by staining) varied from 34.5 to 98.8% (=81.3%) in APEC-1 (n=23), 0 to 98.8% (=62.8%) in APEC-2 (n=26) and 63.3 to 95.4% (=85%) in APEC-3 (n=21). Variability was also observed for pollen size (<n, 2n, &gt; 2n and 4n, in addition to normal n) and pollen size frequency. Abnormalities were observed at the tetrad stage of meiosis in eight plants of APEC-2 with heterogeneous-size pollen. According to the site of pollen tube arrest, pollen-pistil relationships within APEC-1 and APEC-2 revealed events of cross-incompatibility and/or self-incompatibility, whereas only cross-incompatibility was detected within APEC-3. No relations were found between morphological phenotypes and pollen-pistil reactions, and between corolla shape and pollen viability. The results are indicative of a likely hybrid origin of the studied populations and the need for revising the current taxonomic approaches in wild potatoes. 1 EBN: Endosperm Balance Number (Johnston et al., 1980<hr/>Argentina es centro de diversidad de aproximadamente 35 especies silvestres de papa, que tienen amplia distribución geográfica. Estas especies, que forman series poliploides con 2n=2x=24 hasta 2n=6x=72 (x=12), pueden reproducirse tanto sexual como asexualmente. La mayoría de ellas son diploides, y alógamas obligadas debido a que poseen un sistema de auto-incompatibilidad gametofítica. En la naturaleza, las papas silvestres presentan barreras de aislamiento reproductivo externas e internas, dentro y entre poblaciones, que pueden ser incompletas. A la mayoría de las colecciones de bancos de germoplasma se les ha asignado categoría específica en base a fenotipos morfológicos (concepto de especie taxonómica), sin considerar el comportamiento reproductivo natural de las poblaciones muestreadas. Una de estas especies, Solanum chacoense Bitter (2n=2x=24, 2NBE2), crece espontáneamente desde las provincias del noroeste hasta el sudeste de la provincia de Buenos Aires, en hábitats diversos y superponiéndose en su distribución con otras especies taxonómicas de papa con las que puede hibridarse espontáneamente. Como actividades preliminares de un estudio in situ, se caracterizaron por fenotipos morfológicos de hojas, flores y frutos, viabilidad de polen y relaciones polen-pistilo, tres poblaciones naturales de Balcarce, provincia de Buenos Aires, clasificadas como S. chacoense (APEC-1, APEC-2 y APEC-3). El porcentaje de viabilidad del polen (determinado por tinción) varió de 34,5 a 98,8% (=81.3%) en APEC-1 (n=23), 0 a 98,8% (=62.8%) en APEC-2 (n=26) y 63,3 a 95,4% (=85%) en APEC-3 (n=21). Además, se observó variabilidad para tamaño de polen (<n, 2n, &gt;2n y 4n, en adición al polen n normal) y para frecuencia según tamaño. Se observaron anormalidades en el estadio de tétrada en ocho plantas de APEC-2 con polen de tamaño heterogéneo. De acuerdo al sitio de detención del tubo polínico, las relaciones polen-pistilo dentro de APEC-1 y APEC-2 revelaron eventos de incompatibilidad cruzada y/o autoincompatibilidad mientras que en APEC-3 sólo se detectó incompatibilidad cruzada. No se encontraron relaciones entre fenotipos morfológicos y reacciones polen-pistilo, ni entre forma de corola y viabilidad de polen. Los resultados obtenidos son indicativos de un posible origen híbrido de las poblaciones estudiadas y de la necesidad de revisar el enfoque taxonómico en las papas silvestres. 2 NBE: Número de Balance del Endosperma (Johnston et al., 1980) <![CDATA[Componentes principales en mapeo asociativo]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332014000300003&lng=es&nrm=iso&tlng=es El mapeo asociativo (o mapeo por desequilibrio de ligamiento) permite encontrar lugares específicos del genoma relacionados con la variación de un carácter fenotípico. Es una práctica difundida en el mejoramiento de especies vegetales ya que no necesita la utilización de poblaciones provenientes de cruzamientos controlados. Sin embargo, se ha detectado que en poblaciones estructuradas genéticamente, el número de falsos positivos en la asociación marcador-carácter puede aumentar significativamente. El análisis de componentes principales constituye una herramienta para identificar la estructura y expresar la misma en un número reducido de componentes principales (CPs). Entonces, estos CPs se pueden incorporar como covariables en el modelo de asociación. Diferentes estrategias de modelado se pueden utilizar para tener en cuenta la estructura genética en el mapeo de asociación. El objetivo de este trabajo fue estimar las tasas de falsos positivos derivados de la aplicación de tres modelos estadísticos diferentes de mapeo bajo poblaciones estructuradas. Los modelos comparados fueron M1: sin corrección por estructura, M2: con las CPs como covariables de efectos fijos y M3: incluyendo las mismas CPs como covariables de efectos aleatorios en el marco de un modelo lineal mixto. La comparación se realizó usando datos reales y simulados de una especie autógama. Los resultados sugieren que la corrección con las CPs como covariables aleatorias disminuye la tasa de falsos positivos en la inferencia de asociaciones marcador-carácter.<hr/>Association mapping (or linkage disequilibrium mapping) is used to find specific parts of the genome associated with phenotypic trait variation. It is a widely used in plant breeding because it allows the use of populations that do not come from specific experimental designs. If the population of individuals used in association mapping is genetically structured, the number of false positives, in the marker-trait association, increases. Several strategies can be used to model associations taken into account the underlying genetic structure. The principal components analysis can be used to identify the structure and express it in a reduced number of principal components (PCs). Then, these PCs can be incorporated as covariates in the association model. Different models strategies can be used to account for genetic structure in association mapping. The aim of this paper is to estimate expected false positive rates in association mapping performed by three different statistical models, under genetically structured populations. Compared models were M1: without correction for structure, M2: including PCs, as covariates of fixed effects, and M3: including PCs as random effects within a linear mixed model. Model comparison was performed using both, real and simulated data, for self-pollinated specie. The results suggested that the use of PCs as random covariates decreases the false positive rate in the inference of marker-trait associations. <![CDATA[Suplementación de cultivos de sangre periférica con sulfato de zinc: inestabilidad genómica asociada a su deficiencia y exceso]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332014000300004&lng=es&nrm=iso&tlng=es El Zinc (Zn) juega un papel vital en el crecimiento de los niños y participa en la síntesis y mantenimiento del ADN. Las actuales recomendaciones de ingesta de nutrientes no tienen en cuenta los niveles requeridos para el mantenimiento de la estabilidad genómica. El objetivo del trabajo es analizar el efecto citotóxico y genotóxico de la suplementación in vitro con Zn para evaluar la deficiencia y el exceso, así como las concentraciones dentro del rango fisiológico normal establecido para niños (80-280 μg/dl). Para lograr la deficiencia de Zn, el medio HAMF12 (HF12) fue quelado (HF12Q). Los linfocitos fueron aislados de donantes sanos y cultivados durante 7 días: 1-control (HF12, 60 μg/dl SO4Zn); 2-deficiente (HF12Q, 0 μg/dl SO4Zn); 3-80 (HF12Q + 80 μg/dl SO4Zn); 4-180 (HF12Q + 180 μg/dl SO4Zn); 5-280 (HF12Q + 280 μg/dl SO4Zn); 6-380 (HF12Q + 380 μg/dl SO4Zn). Se utilizaron los ensayos de micronúcleo y cometa y se determinó la viabilidad celular. Las diferencias fueron evaluadas con χ2 y ANOVA (p<0,05). El índice de daño, resultó significativamente más alto en el cultivo deficiente respecto de los demás. Sólo la dosis 380 μg/dl presentó frecuencias significativamente aumentadas en relación a los otros cultivos suplementados. La frecuencia de micronúcleos (MNi) fue significativamente mayor en los cultivos deficientes, 280 y 380 μg/dl, respecto del control, 80 y 180 μg/dl. La mayor fecuencia se observó en 380 μg/dl. La suplementación de los cultivos in vitro con zinc ayudaría a reducir la inestabilidad genómica. Las dosis más beneficiosas serían las de 80 y 180 μg/dl, en tanto que las de 280 y 380 μg/dl provocarían un aumento de daño en el ADN.<hr/>Zinc (Zn) plays a vital role in children growth and is involved in DNA synthesis and maintenance processes. The current nutrient intake recommendations do not consider the levels required for maintaining genomic stability. The objective of this study is to analyze the cytotoxic and genotoxic effect of in vitro Zn supplementation to evaluate deficiency and excess, and the concentrations within the normal physiological range established for children (80-280 μg/dl). To achieve Zn deficiency, the HAMF12 medium (HF12) was chelated (HF12Q). Lymphocytes were isolated from healthy donors and cultured for 7 days: 1-control (HF12, 60 μg/dl SO4Zn); 2-deficient (HF12Q, 0 μg/dl SO4Zn); 3-80 (HF12Q + 80 μg/dl SO4Zn); 4-180 (HF12Q + 180 μg/dl SO4Zn); 5-280 (HF12Q + 280 μg/dl SO4Zn); 6-380 (HF12Q + 380 μg/dl SO4Zn). Comet and micronucleus assays were performed, and cell viability was determined. Differences were evaluated with χ2 and ANOVA (p<0.05). The DNA damage index (comet assay) was significantly higher in the deficient culture respect to the others. Only the 380 μg/dl dose showed significantly increased frequency in DNA damage in relation to the other supplemented cultures. Micronuclei frequency was significantly higher in the deficient, 280 and 380 μg/dl cultures in comparison with the control, 80 and 180 μg/dl. The higher frequency of chromosomal damage was observed at 380 μg/dl SO4Zn. In vitro Zn supplementation reduced genomic instability. Supplementation with Zn at 80 μg/dl and 180 μg/dl proved to be the most beneficial in reducing genomic instability, whereas doses of 280 and 380 μg/dl would cause an increase in DNA damage. <![CDATA[Efecto del berro sobre el daño inducido al ADN, la reparación del ADN y la actividad de la glicoproteína p en linfocitos humanos]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332014000300005&lng=es&nrm=iso&tlng=es Cruciferae vegetables are widely studied due to their potential anticarcinogenic properties. In the present work we analyzed the antigenotoxic effect of watercress (Nasturtium officinale, W. Aiton), a member of this family. The vegetal was processed, and the juice obtained was evaluated in relation with genetic material protection and DNA repair capacity against two deleterious agents: mitomycin C and hydrogen peroxide. The antigenotoxic properties were analyzed through cytokinesis block micronucleus test and comet assay (standard and with endonuclease), respectively. Besides, we tested the functionality of P-glycoprotein in human lymphocytes exposed to the whole extract. Watercress had no effect on mitomycin cytostatic effect (p&gt;0.05) and although a decrease trend in micronuclei frequency was observed no statistical difference was found. In relation to DNA repair, a reduction in damage index was observed (p<0.001) since 4 hours of incubation with the juice but it did not reduce the number of oxidized pyrimidines. Respect to P-glycoprotein transporter, our results indicate that the juice of watercress did not change the activity of protein. In conclusion, to better understand the real beneficial effect of watercress in vitro, further studies are needed to elucidate the mechanism behind the chemopreventive effect observed.<hr/>Las crucíferas son ampliamente estudiadas dado sus potenciales propiedades anticarcinogénicas. En el presente trabajo, analizamos el efecto antigenotóxico del berro (Nasturtium officinale, W. Aiton), un miembro de esta familia. El vegetal fue procesado y el jugo obtenido fue evaluado en relación a la protección y reparación del daño al material genético inducido por dos agentes deletéreos: mitomicina C y peróxido de hidrógeno. Las propiedades antigenotóxicas fueron analizadas a través del test del micronúcleo con bloqueo de la citocinesis y el ensayo cometa (estándar y con endonucleasa), respectivamente. Además, evaluamos la funcionalidad de la glicoproteína P en linfocitos humanos expuestos al extracto completo. El berro no modificó el efecto citostático de la mitomicina (p&gt;0,05) y si bien se determinó una tendencia decreciente en la frecuencia de micronúcleos no se encontraron diferencias estadísticamente significativas. En relación a la reparación del ADN, se determinó una disminución del índice de daño (p<0,001) a partir de las cuatro horas de exposición al jugo sin existir cambios en el número de pirimidinas oxidadas. Respecto del transportador, nuestros resultados indican que el jugo de berro no modifica la actividad de la proteína. En conclusión, para lograr entender con mayor claridad el beneficio real del berro in vitro, es necesario realizar otros estudios con el fin de elucidar el mecanismo subyacente a los efectos quimiopreventivos observados. <![CDATA[Registro de cultivar CUMÉ-UNRC]]> http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332014000300006&lng=es&nrm=iso&tlng=es Cruciferae vegetables are widely studied due to their potential anticarcinogenic properties. In the present work we analyzed the antigenotoxic effect of watercress (Nasturtium officinale, W. Aiton), a member of this family. The vegetal was processed, and the juice obtained was evaluated in relation with genetic material protection and DNA repair capacity against two deleterious agents: mitomycin C and hydrogen peroxide. The antigenotoxic properties were analyzed through cytokinesis block micronucleus test and comet assay (standard and with endonuclease), respectively. Besides, we tested the functionality of P-glycoprotein in human lymphocytes exposed to the whole extract. Watercress had no effect on mitomycin cytostatic effect (p&gt;0.05) and although a decrease trend in micronuclei frequency was observed no statistical difference was found. In relation to DNA repair, a reduction in damage index was observed (p<0.001) since 4 hours of incubation with the juice but it did not reduce the number of oxidized pyrimidines. Respect to P-glycoprotein transporter, our results indicate that the juice of watercress did not change the activity of protein. In conclusion, to better understand the real beneficial effect of watercress in vitro, further studies are needed to elucidate the mechanism behind the chemopreventive effect observed.<hr/>Las crucíferas son ampliamente estudiadas dado sus potenciales propiedades anticarcinogénicas. En el presente trabajo, analizamos el efecto antigenotóxico del berro (Nasturtium officinale, W. Aiton), un miembro de esta familia. El vegetal fue procesado y el jugo obtenido fue evaluado en relación a la protección y reparación del daño al material genético inducido por dos agentes deletéreos: mitomicina C y peróxido de hidrógeno. Las propiedades antigenotóxicas fueron analizadas a través del test del micronúcleo con bloqueo de la citocinesis y el ensayo cometa (estándar y con endonucleasa), respectivamente. Además, evaluamos la funcionalidad de la glicoproteína P en linfocitos humanos expuestos al extracto completo. El berro no modificó el efecto citostático de la mitomicina (p&gt;0,05) y si bien se determinó una tendencia decreciente en la frecuencia de micronúcleos no se encontraron diferencias estadísticamente significativas. En relación a la reparación del ADN, se determinó una disminución del índice de daño (p<0,001) a partir de las cuatro horas de exposición al jugo sin existir cambios en el número de pirimidinas oxidadas. Respecto del transportador, nuestros resultados indican que el jugo de berro no modifica la actividad de la proteína. En conclusión, para lograr entender con mayor claridad el beneficio real del berro in vitro, es necesario realizar otros estudios con el fin de elucidar el mecanismo subyacente a los efectos quimiopreventivos observados. <link>http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332014000300007&lng=es&nrm=iso&tlng=es</link> <description/> </item> </channel> </rss> <!--transformed by PHP 08:05:56 24-05-2015-->