Abstract

VELAZQUEZ-SEPULVEDA, I; OROZCO-MOSQUEDA, MC; PRIETO-BARAJAS, CM  and  SANTOYO, G. Diversidad bacteriana asociada a la rizósfera de plantas de trigo (Triticum aestivum): Hacia un análisis metagenómico. Phyton (B. Aires) [online]. 2012, vol.81, n.1, pp.81-87. ISSN 1851-5657.

El suelo rizosférico es uno de los reservorios más grandes de la diversidad genética microbiana. Antes de realizar un estudio metagenómico a gran escala de un ambiente, tal como el suelo rizosférico, es necesario realizar un análisis previo de la diversidad genética residente. Por ello, en este trabajo se detectó la diversidad bacteriana asociada a la rizósfera de plantas de trigo por medio de la amplificación de PCR, construcción de una biblioteca y secuenciación de los genes 16S ribosomales. Se detectaron 30 OTUs, incluyendo las Clases Alfaproteobacteria, Betaproteobacteria, Deltaproteobacteria, Gammaproteobateria, Actinobacteria, Bacilli, Clostridia y bacterias no cultivables. Dentro de las Gammaproteobateria, los géneros más abundantes fueron Pseudomonas, Stenotrophomonas y Bacillus, ya que correspondieron al 40% del total de la biblioteca ribosomal completa. El análisis filogenético demostró que la mayoría de las secuencias ribosomales se agrupan en los clados que pertenecen a bacterias comunes del suelo o rizosféricas. Para determinar si la muestra es bastante diversa se llevó a cabo una prueba de Shannon-Wiener, resultando en una tasa de 3,8 bits por individuo. Nuestros resultados sugieren que la rizósfera de plantas de trigo es muy diversa y resulta un candidato excelente para otro tipo de análisis metagenómicos.

Keywords : Diversidad bacteriana; Rizósfera; Trigo; Genes 16S ribosomales.

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