MICROBIOLOGÍA

Diversidad genética de cepas de Escherichia coli O145:NM/H27 aisladas en la provincia de Buenos Aires*

Genetic diversity of Escherichia coli 0145:NM/H27 strains isolated in Buenos Aires province

Diversidade genética de cepas de Escherichia coli 0145:NM/H27 isoladas na provincia de Buenos Aires

 

Claudio Marcelo Zotta¹, Isabel Chinen², Silvina Lavayén³, Carolina Carbonari², Victoria Monzani⁴, Laura Morvay⁴, Marta Rivas²

¹ Técnico Químico. Servicio Bacteriología, INE "Dr. Juan H. Jara" - ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán".
² Bioquímica. Servicio Fisiopatogenia, INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán".
³ Licenciada en Química. Servicio Bacteriología, INE "Dr. Juan H. Jara" - ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán".
⁴ Bioquímica. Hospital Interzonal Materno Infantil "Sr. Victorio Tetamanti".

* Instituto Nacional de Epidemiología "Dr. Juan H. Jara" (INE). Departamento Laboratorio de Diagnóstico. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán" (ANLIS), Ituzaingó 3520, (7600) Mar del Plata, Argentina.
* Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI). Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán" (ANLIS), Av. Vélez Sarsfield 563, (1281) Buenos Aires, Argentina.
* Hospital Interzonal Especializado Materno Infantil (HIEMI) "Sr. Victorio Tetamanti", Castelli 2450, (7600) Mar del Plata, Argentina.

 

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Resumen

Escherichia coli productora de toxina Shiga (STEC), fundamentalmente del serotipo O157:H7, está asociada a la ocurrencia de casos esporádicos y brotes de diarrea sanguinolenta (DS) y síndrome urémico hemolítico (SUH). Otros serotipos STEC como O26:H11, O103:H2, O111:NM, O113:H21 y O145:NM también pueden causar enfermedad severa. En Argentina O157:H7 es el serotipo prevalente siguiéndole en frecuencia O145:NM. El objetivo del presente trabajo fue establecer la diversidad genética y la relación clonal de cepas de E. coli O145:NM/H27 aisladas en diferentes localidades de la provincia de Buenos Aires en el período 2004-2009. A 17 cepas aisladas de casos de SUH (9), DS (5) y de contactos asintomáticos (3) se les realizó PCR para detectar genes stx₁, stx₂, rfb_O157, eae y ehxA y electroforesis en gel en campos pulsados (Xbal-PFGE) para establecer diversidad genética y relación clonal. Todos los aislamientos fueron caracterizados genotípicamente como stx₂/eae/ehxA. Por %baI-PFGE se obtuvieron 14 patrones diferentes, identificándose un único Cluster. Mediante la sub-tipificación molecular se conformó la base de datos de E. coli O145:NM/ H27 aislados en la región que permitirá monitorear los perfiles %baI-PFGE a fin de identificar tempranamente la probable ocurrencia de un brote en la población y notificar a las autoridades para aplicar acciones de control.

Palabras clave: diversidad genética ; relación clonal ; Escherichia coli O145:NM/H27 ; electroforesis en gel en campos pulsados

Summary

SHIGA TOXIN-PRODUCING Escherichia coli (STEC), especially the serotype 0157-.H7, is associated with the occurrence of sporadic cases and outbreaks of bloody diarrhea (DS) and hemolytic uremic syndrome (HUS). Other STEC serotypes such as 026:H11, 0103:H2, 0111:NM, 0113:H21, and 0145:NM can also cause severe human illness. In Argentina 0157:H7 is prevalent, followed in frequency by serotype 0145:NM. The aim of this study was to determine the genetic diversity and clonal relationship of E. coM 0145:NM/ H27 strains isolated in different locations of the Buenos Aires province, in the period 2004-2009. A total of 17 strains isolated from HUS (9), DS (5) and asymptomatic contacts (3) were characterizea by POR to detect stXj, stx₂, rfb_O157, eae and ehxA genes, and pulsed-field gel electrophoresis (Xbal-PFGE) to establish the genetic diversity and the clonal relationship. All isolates were characterized as stx₂/eae/ehxA. By Xba\-PFGE, 14 different patterns were established, with a single cluster identified. A regional database of E. coii 0145:NM/H27 was created, which will monitor the \-PFGE profiles of the circulating strains in order to identify the probable occurrence of an outbreak in the community and report to the authorities to implement control measures.

Keywords: genetic diversity ; clonal relationship ; Escherichia coli O145.NM/H27 ; pulsed-field gei electrophoresis

Resumo

Escherichia coii produtora de toxina Shiga (STEO), especialmente do sorotipo 0157:H7, é associado com a ocorrència de casos esporádicos e surtos de diarreia sanguinolenta (DS) e a síndrome urèmica hemolítica (HUS). 0utros sorotipos STEO como 026H11, 0103H2, 0111NM, 0113H21, e 0145NM também podem causar doengas severas. Na Argentina, é o sorotipo prevalente seguindo em frequència 0145-.NM. 0 objetivo deste estudo foi determinar a diversidade genética e a relagäo clonal de cepas de E. coii 0145:NM/H27 isoladas em diferentes locais da provincia de Buenos Aires, no período 2004-2009. Foi realizado POR em um total de 17 cepas isoladas de casos de HUS (9), DS (5) e de contatos assintomáticos (3) para detectar genes stx₁, stx₂, rfb_O157, eae e ehxA e eletroforese em gel em campos pulsados (Xba\ -PFGE) para estabelecer diversidade genética e a relagäo clonal. Todos os isolamentos foram caracterizados genotipicamente como stx₂/eae/ehxA. Por Xba\-PFGE foram obtidos 14 padröes diferentes, identificando um só cluster. Através da subtipificagäo molecular foi conformada a base de dados de E. coii 0145:NM/H27 isolados na regiäo, que irá permitir monitorar os perfis Xba\-PFGE visando identificar precocemente a provável ocorrència de um surto na populagäo e notificar às autoridades para implementar medidas de controle.

Palavras-chave: diversidade genética ; relagäo clonal ; Escherichia coli O145.NM/H27 ; eletroforese em campos pulsados

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Introducción

Escherichia coli productora de toxina Shiga (STEC) está asociada a la presentación de casos esporádicos y brotes de diarrea sanguinolenta (DS) y síndrome urémico he-molítico (SUH). El impacto clínico-epidemiológico de este agente emergente está relacionado con el número de personas afectadas y la gravedad de las enfermedades asociadas. En la Argentina se notifican aproximadamente 400 casos nuevos de SUH anuales (1).

La mayoría de los brotes epidémicos y casos esporádicos de SUH se han asociado con cepas STEC del serotipo O157:H7/NM, aislándose además otros sero-tipos como O26:H11, O103:H2, O111:NM, O113:H21 y O145:NM (2-4). En Argentina, el serotipo O157:H7 es el prevalente siendo O145:NM el segundo serotipo en orden de frecuencia. El ganado bovino y otros rumiantes domésticos constituyen el reservorio más importante de estos agentes. El consumo de alimentos contaminados, principalmente los de origen bovino, el contacto directo e indirecto con animales, y la transmisión persona a persona han sido señalados como las vías más importantes de transmisión de STEC (5). Esta última vía de infección ha sido documentada en jardines maternales y de infantes, geriátricos y centros de asistencia psiquiátrica, entre otros (6)(7).

A nivel mundial se han notificado numerosos brotes (8-11). Sin embargo, ciertos eventos que suelen ser difusos, y no tan fácilmente identificables por epidemiología, pueden ser detectados mediante técnicas de epidemiología molecular como la electroforesis de campo pulsado (PFGE) en tiempo real. Esta técnica permite detectar un aumento en la frecuencia de un mismo patrón de PFGE en un determinado lugar y tiempo, lo cual estaría indicando un incremento en el número de casos (conglomerado o cluster) debido a una misma cepa (12).

Según el Sistema Nacional de Vigilancia de la Salud (SNVS), el SUH es una enfermedad de notificación obligatoria, inmediata e individualizada. Además, mediante la estrategia de Unidades Centinela, la Argentina trabaja en el marco de la Red PulseNet Internacional, a través de la Red de América latina y El Caribe. Esta Red de Laboratorios realiza la caracterización molecular de bacterias patógenas de transmisión alimentaria por PFGE. Esto permite: 1) identificar casos de enfermedades transmitidas por alimentos que ocurren al mismo tiempo en áreas geográficas separadas, producidas por el mismo agente etiológico; 2) identificar el vehículo de transmisión y así establecer las medidas de intervención correspondientes y 3) diferenciar un brote de un "pseudobrote" o de casos esporádicos (13).

El crecimiento continuo de las Bases de Datos Nacionales (DBN) mediante la aplicación de PFGE en la vigilancia de patógenos de transmisión alimentaria a nivel nacional permite monitorear los patrones circulantes y su distribución en las diferentes regiones del país. Asimismo, resulta de gran utilidad para el estudio de brotes (14).

El objetivo del presente trabajo fue establecer la diversidad genética y la relación clonal de cepas de E. coli O145:NM/H27 aisladas de casos de SUH, de DS y de contactos familiares convivientes asintomáticos de casos de SUH (CA), ocurridos en distintas localidades de la provincia de Buenos Aires en el período 2004-2009.

Materiales y Métodos

Se estudiaron 17 cepas aisladas de casos de SUH, casos de DS y de CA, provenientes de la ciudad de Mar del Plata y de localidades cercanas en el ámbito de la provincia de Buenos Aires, correspondientes al período 2004-2009.

El estudio microbiológico se realizó a partir de muestras de materia fecal. En los casos de SUH y de DS las muestras fueron tomadas en el HIEMI, hospital interzonal de atención general y designado como Unidad Centinela para la vigilancia de SUH en la región. Los CA remitieron las muestras de materia fecal al Instituto Nacional de Epidemiología - ANLIS Dr. Carlos G. Mal-brán, Mar del Plata.

Para la detección de STEC las muestras de materia fecal fueron sembradas en placas de agar MacConkey con Sorbitol (SMAC) (Difico, Laboratorios, Detroit, MI) las cuales fueron incubadas a 37 °C durante 18 h, por cultivo directo y luego del enriquecimiento por incubación de 6 h a 37 °C en caldo tripticasa soya (CTS) (Britania, Argentina) suplementado con 50 mg/L de cefixima y 2,5 mg/L de telurito de potasio (bioMérieux Marcy/Étoile, France) (CT-CTS) (13).

La identificación bioquímica y la serotipificación se realizaron según protocolo (13). Para la serotipificación de los aislamientos se utilizó antisuero de E. coli monovalente somático O145, provisto por el Instituto de Producción de Biológicos-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán".

Las cepas fueron caracterizadas por la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR múltiple) utilizándose los oligonucleótidos específicos que amplifican los fragmentos de los genes de las toxinas Shiga 1 y 2 (stx₁, st*2) y el gen r/b_O157 (9). La caracterización ge-notípica de los marcadores de virulencia accesorios, eae y enterohemolisina (ehxA) se efectuó también por PCR según lo descripto por Ganon et al. (15) y por Schmidt, et al. (16) respectivamente.

Se determinó el perfil de sensibilidad de las cepas aisladas según el método de difusión por discos de Kirby y Bauer de acuerdo a las recomendaciones del CLSI (17).

Para la subtipificación de los aislamientos de STEC se aplicó la técnica de macrorrestricción con la enzima XbaI y separación por electroforesis de campo pulsado ( XbaI-PFGE) y BlnI ( BlnI-PFGE) fue utilizada como segunda enzima, según lo requerido en el protocolo estandarizado por los Centers for Diseases Control and Prevention, Atlanta, GA, EE.UU. para la Red PulseNet, con algunas modificaciones. La relación clonal entre los aislamientos se estableció utilizando el software BioNumerics versión 4.61 (Applied Maths, Kortrijk, Belgium) (18).

Resultados

Los 17 aislamientos de E. coli O145 estudiados provenían de: 9 casos de SUH, todos pacientes internados cuyas edades estaban comprendidas entre 7 meses y 5 años y medio (media=2,0 años; mediana=2,0 años); 5 casos de DS cuyo rango de edad estaba comprendido entre 7 meses y 7 años (media=2,8 años; mediana=2,0 años); y 3 CA, 2 menores de 3 y 8 años, y un adulto de 36 años.

Del total de las cepas de E. coli, 16 (94,1%) correspondieron al serotipo O145:NM y una (5,9%) a O145:H27. Todas fueron fermentadoras de sorbitol y sensibles a los antimicrobianos ensayados según el protocolo de vigilancia de STEC, excepto un aislamiento que presentó resistencia en bloque a ampicilina, tetraciclina y trimetoprima-sulfametoxazol.

Todos los aislamientos fueron caracterizados genotipicamente como stx₂, eae, ehxA.

Por XbaI-PFGE se obtuvieron 14 patrones diferentes, de los cuales 11 resultaron ser patrones únicos, no asociados previamente a casos clínicos. Se identificó un cluster formado por 4 cepas con patrón AREN-MX01.0061 que también resultaron indistinguibles por SM-PFGE (patrón ARENMA26.0001). Los patrones obtenidos en el área se compararon con las BDN y se observó identidad con 3 patrones presentes en la misma: ARENMX0.0006, que resulta ser el más frecuente con aislamientos de diferentes provincias como Buenos Aires, Santa Fe y Neuquén; ARENMX01.0004 aislado en Buenos Aires, Santa Fe y Tucumán; y ARENMX01.0016 recuperado en 2001 en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires. La distribución de patrones según serotipo, factores de virulencia, diagnóstico, localidad y año de aislamiento se presenta en la Figura 1.

Figura 1. Relación clonal de las cepas de E. coli Q145:NM/H27 aisladas en distintas localidades de la provincia de Buenos Aires.

Discusión y Conclusiones

Todos los aislamientos de E. coli O145:NM/H27 portaron el gen stx2 que codifica para la producción de la toxina Shiga 2. La capacidad patogénica de las cepas STEC se relaciona con el tipo de toxina Shiga que producen y con la presencia de otros factores de virulencia adicionales (19).

El total de las cepas STEC estudiadas fueron positivas para secuencias relacionadas con los genes eae y ehxA, por PCR. El gen eae es un marcador estable de la presencia de la isla de patogenicidad LEE (del inglés, Locus of Enterocyte Effacement) y numerosos estudios han demostrado la asociación entre LEE y la capacidad de las cepas STEC para causar enfermedades graves. La presencia del gen ehxA también se asocia fuertemente con la patogenia de STEC (20).

Por Xbal-PFGE se determinó la alta diversidad genética de las cepas circulantes (14 patrones), 11 de los cuales resultaron ser patrones únicos, no asociados previamente a casos clínicos. Sin embargo, se pudo identificar un cluster (clusterdefinido como grupo de cepas que presentan idéntico patrón de PFGE), que podría tratarse de la posible presentación de un brote con características de "difuso" en la ciudad de Mar del Plata (12). Lamentablemente, los datos epidemiológicos fueron insuficientes como para establecer un nexo entre los casos.

En conclusión, mediante la subtipificación molecular se determinó la alta diversidad genética de las cepas circulantes, como así también a partir de los resultados obtenidos se conformó una base de datos de E. coli O145:NM/H27 de la región en la que se realizó el estudio, que permitirá monitorear las diferencias en los perfiles detectados, con el propósito de identificar en forma temprana la probable ocurrencia de un brote en la población y notificar a las autoridades para la aplicación de acciones de control.

La aplicación de Xbal-PFGE como técnica de epidemiología molecular en tiempo real resulta fundamental brindando especificidad a la vigilancia de este patógeno y consolidando los resultados de laboratorio con los de epidemiología.

CORRESPONDENCIA

CLAUDIO MARCELO ZOTTA E-mail: marcelozotta@hotmail.com

Referencias bibliográficas

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Aceptado para su publicación el 30 de julio de 2013